16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2812 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2812  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  221  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111717  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1398  hypothetical protein  91.76 
 
 		 85 aa  160  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957454 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0909  hypothetical protein  75.64 
 
 		 81 aa  124  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.593051  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1268  hypothetical protein  52.56 
 
 		 81 aa  87.4  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.277803  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1090  hypothetical protein  51.28 
 
 		 81 aa  85.5  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.869282  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1335  hypothetical protein  49.33 
 
 		 84 aa  81.6  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000547457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3227  hypothetical protein  50.65 
 
 		 79 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000161134  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0742  hypothetical protein  44.59 
 
 		 89 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.568027  normal  0.756867 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1149  hypothetical protein  45.45 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3728  hypothetical protein  41.25 
 
 		 82 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.208374  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3016  hypothetical protein  43.59 
 
 		 84 aa  72  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.93406e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1110  hypothetical protein  40.96 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.578339 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0611  hypothetical protein  38.96 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2789  hypothetical protein  41.33 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.264247  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01280  hypothetical protein  39.74 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1637  hypothetical protein  38.75 
 
 		 83 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310686 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>