63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0706 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0706  addiction module toxin, Txe/YoeB family  100 
 
 
97 aa  193  7e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0726  addiction module toxin, Txe/YoeB family  44.44 
 
 
93 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2586  addiction module toxin, Txe/YoeB family  42.7 
 
 
93 aa  72.8  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0231  addiction module antitoxin  40 
 
 
93 aa  68.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.116494  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1914  addiction module toxin, Txe/YoeB family  45.21 
 
 
97 aa  67  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.197828  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1930  addiction module toxin, Txe/YoeB  38.89 
 
 
93 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1443  addiction module toxin, Txe/YoeB family  29.35 
 
 
92 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.403552  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4647  addiction module toxin, Txe/YoeB family  34.09 
 
 
87 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00453645  normal  0.644511 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0662  hypothetical protein  35.38 
 
 
87 aa  50.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1926  addiction module toxin, Txe/YoeB family  31.33 
 
 
84 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1069  addiction module antitoxin  33.33 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0150746  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2294  addiction module toxin, Txe/YoeB family  31.33 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0193925 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2859  addiction module toxin, Txe/YoeB family  29.85 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2026  addiction module toxin, Txe/YoeB family  30.77 
 
 
87 aa  47.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00150799  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2939  hypothetical protein  34.92 
 
 
84 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2088  addiction module toxin, Txe/YoeB  33.33 
 
 
110 aa  47.4  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000111653  unclonable  0.0000000950728 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1523  addiction module toxin, Txe/YoeB family  32.31 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.370643  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3488  addiction module toxin, Txe/YoeB  34.92 
 
 
88 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0115937  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0703  addiction module toxin, Txe/YoeB family  30.67 
 
 
233 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.564313  normal  0.609374 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1753  addiction module antitoxin  26.97 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.709667  normal  0.0794356 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4878  addiction module antitoxin  34.92 
 
 
88 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4766  addiction module antitoxin  35.48 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1940  addiction module toxin, Txe/YoeB family  31.11 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0843  addiction module toxin, Txe/YoeB  34.92 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0804011 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5408  addiction module antitoxin  34.92 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.808403  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2607  addiction module antitoxin  30 
 
 
86 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1444  addiction module antitoxin  30.53 
 
 
88 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0312  addiction module antitoxin  29.55 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2008  hypothetical protein  27.91 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0280496  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2262  addiction module antitoxin  28.89 
 
 
87 aa  45.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1840  hypothetical protein  26.19 
 
 
83 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.182478  normal  0.185437 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1546  addiction module toxin, Txe/YoeB family  33.33 
 
 
83 aa  44.3  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0988  addiction module antitoxin  28.57 
 
 
63 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1100  addiction module toxin, Txe/YoeB  33.85 
 
 
89 aa  44.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0461  hypothetical protein  34.72 
 
 
1074 aa  44.3  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0455  hypothetical protein  34.72 
 
 
1074 aa  44.3  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1792  addiction module toxin, Txe/YoeB family  30.56 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00863649  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1786  addiction module antitoxin  26.88 
 
 
87 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4022  addiction module antitoxin  28.89 
 
 
84 aa  43.5  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3893  addiction module toxin, Txe/YoeB family  30.65 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5886  addiction module antitoxin  33.87 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5486  addiction module toxin, Txe/YoeB  33.87 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.617612 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0246  addiction module toxin, Txe/YoeB family  28.57 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1307  addiction module toxin, Txe/YoeB  29.03 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3815  hypothetical protein  27.42 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000264023 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0793  addiction module antitoxin  27.71 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3299  addiction module toxin Txe/YoeB family  22.99 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13394  hypothetical protein  28.74 
 
 
85 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0756561 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0336  hypothetical protein  30.77 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.689811  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4635  addiction module toxin, Txe/YoeB  33.87 
 
 
84 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242001  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1207  addiction module toxin, Txe/YoeB  27.17 
 
 
87 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.927774  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0045  addiction module toxin, Txe/YoeB family  30.56 
 
 
87 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1700  addiction module antitoxin  31.15 
 
 
88 aa  41.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3904  addiction module antitoxin  27.71 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256744  normal  0.0837513 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2091  RelE  26.37 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.347779  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1401  addiction module antitoxin  27.42 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.508052  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3569  addiction module toxin, Txe/YoeB family  32.81 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00359061  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2537  addiction module toxin, Txe/YoeB family  32.81 
 
 
86 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2532  addiction module antitoxin  31.03 
 
 
88 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000423523  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0074  addiction module toxin, Txe/YoeB family  27.78 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5998  prevent-host-death protein:addiction module toxin, Txe/YoeB  33.93 
 
 
106 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2483  addiction module antitoxin  31.03 
 
 
88 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000373536  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2573  addiction module toxin, Txe/YoeB family  43.75 
 
 
88 aa  40.4  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000405967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>