41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1792 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1792  addiction module toxin, Txe/YoeB family  100 
 
 
86 aa  176  8e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00863649  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0074  addiction module toxin, Txe/YoeB family  56.47 
 
 
87 aa  111  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1444  addiction module antitoxin  57.65 
 
 
88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1786  addiction module antitoxin  55.29 
 
 
87 aa  107  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2607  addiction module antitoxin  54.65 
 
 
86 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2262  addiction module antitoxin  56.47 
 
 
87 aa  105  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0870  addiction module toxin, Txe/YoeB family  49.41 
 
 
87 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0995  addiction module toxin, Txe/YoeB family  49.41 
 
 
87 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000552996 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0045  addiction module toxin, Txe/YoeB family  50.59 
 
 
87 aa  97.4  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2963  addiction module antitoxin  52.44 
 
 
82 aa  80.9  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1546  addiction module toxin, Txe/YoeB family  42.35 
 
 
83 aa  72.4  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2483  addiction module antitoxin  37.65 
 
 
88 aa  63.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000373536  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2532  addiction module antitoxin  37.65 
 
 
88 aa  63.9  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000423523  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1914  addiction module toxin, Txe/YoeB family  41.77 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.197828  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1753  addiction module antitoxin  40.91 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.709667  normal  0.0794356 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1930  addiction module toxin, Txe/YoeB  38.46 
 
 
93 aa  49.7  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2586  addiction module toxin, Txe/YoeB family  27.59 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1443  addiction module toxin, Txe/YoeB family  28.41 
 
 
92 aa  47.8  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.403552  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3569  addiction module toxin, Txe/YoeB family  37.65 
 
 
88 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00359061  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2537  addiction module toxin, Txe/YoeB family  37.65 
 
 
86 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0726  addiction module toxin, Txe/YoeB family  28.41 
 
 
93 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5886  addiction module antitoxin  34.57 
 
 
85 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5486  addiction module toxin, Txe/YoeB  34.57 
 
 
85 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.617612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4647  addiction module toxin, Txe/YoeB family  38.46 
 
 
87 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00453645  normal  0.644511 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0706  addiction module toxin, Txe/YoeB family  30.56 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2939  hypothetical protein  40.68 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1700  addiction module antitoxin  40.74 
 
 
88 aa  42.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2859  addiction module toxin, Txe/YoeB family  39.62 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0408  addiction module antitoxin  41.94 
 
 
86 aa  42.7  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1215  toxin YoeB  36.84 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1069  addiction module antitoxin  43.48 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0150746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2308  toxin YoeB  36.84 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.528458  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2026  addiction module toxin, Txe/YoeB family  40.32 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00150799  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0703  addiction module toxin, Txe/YoeB family  37.7 
 
 
233 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.564313  normal  0.609374 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1640  addiction module toxin, Txe/YoeB family  36.84 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0526904  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0988  addiction module antitoxin  33.33 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0312  addiction module antitoxin  36.36 
 
 
84 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0231  addiction module antitoxin  36.71 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.116494  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2091  RelE  36.05 
 
 
91 aa  40.4  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.347779  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0027  addiction module toxin, Txe/YoeB  45.65 
 
 
88 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0189649  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2155  addiction module toxin component YoeB  36.84 
 
 
84 aa  40  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>