85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3488 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3488  addiction module toxin, Txe/YoeB  100 
 
 
88 aa  184  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0115937  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4878  addiction module antitoxin  100 
 
 
88 aa  184  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0843  addiction module toxin, Txe/YoeB  98.86 
 
 
88 aa  183  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0804011 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5408  addiction module antitoxin  97.73 
 
 
88 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.808403  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4766  addiction module antitoxin  98.85 
 
 
88 aa  181  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0555  toxin  72.62 
 
 
86 aa  141  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273353  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3815  hypothetical protein  72.41 
 
 
87 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000264023 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1401  addiction module antitoxin  70.11 
 
 
87 aa  137  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.508052  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1207  addiction module toxin, Txe/YoeB  68.24 
 
 
87 aa  133  7.000000000000001e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.927774  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1307  addiction module toxin, Txe/YoeB  68.67 
 
 
86 aa  128  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4433  addiction module antitoxin  67.47 
 
 
84 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.322385  normal  0.385628 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2447  addiction module antitoxin  65.06 
 
 
86 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1940  addiction module toxin, Txe/YoeB family  62.65 
 
 
84 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0793  addiction module antitoxin  60.24 
 
 
84 aa  117  3.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4022  addiction module antitoxin  61.45 
 
 
84 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1640  addiction module toxin, Txe/YoeB family  57.83 
 
 
84 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0526904  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5886  addiction module antitoxin  61.18 
 
 
85 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2308  toxin YoeB  57.83 
 
 
84 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.528458  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5486  addiction module toxin, Txe/YoeB  61.18 
 
 
85 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.617612 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1215  toxin YoeB  57.83 
 
 
84 aa  115  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0391  addiction module toxin, Txe/YoeB family  62.82 
 
 
84 aa  113  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2155  addiction module toxin component YoeB  56.63 
 
 
84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1926  addiction module toxin, Txe/YoeB family  56.63 
 
 
84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0021013  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3904  addiction module antitoxin  55.42 
 
 
84 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256744  normal  0.0837513 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13394  hypothetical protein  57.65 
 
 
85 aa  111  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0756561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2859  addiction module toxin, Txe/YoeB family  54.76 
 
 
86 aa  111  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2026  addiction module toxin, Txe/YoeB family  60.49 
 
 
87 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00150799  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2294  addiction module toxin, Txe/YoeB family  54.22 
 
 
84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0193925 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4635  addiction module toxin, Txe/YoeB  55.42 
 
 
84 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242001  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2556  addiction module toxin, Txe/YoeB  60 
 
 
86 aa  108  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.307298  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3893  addiction module toxin, Txe/YoeB family  61.25 
 
 
84 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0662  hypothetical protein  61.25 
 
 
87 aa  106  8.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0246  addiction module toxin, Txe/YoeB family  57.14 
 
 
86 aa  107  8.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16290  addiction module toxin, Txe/YoeB family  58.54 
 
 
86 aa  106  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1069  addiction module antitoxin  56.47 
 
 
87 aa  106  1e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0150746  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0027  addiction module toxin, Txe/YoeB  54.02 
 
 
88 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0189649  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1844  hypothetical protein  58.02 
 
 
86 aa  104  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.891967  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01340  toxin-antitoxin system, toxin component, Txe/YoeB family  53.01 
 
 
85 aa  103  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2091  RelE  51.81 
 
 
91 aa  103  7e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.347779  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3299  addiction module toxin Txe/YoeB family  55.81 
 
 
88 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2008  hypothetical protein  58.02 
 
 
84 aa  102  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0280496  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0392  hypothetical protein  57.14 
 
 
88 aa  101  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0040336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0432  hypothetical protein  51.85 
 
 
84 aa  99.4  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1523  addiction module toxin, Txe/YoeB family  51.19 
 
 
89 aa  99  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.370643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2605  addiction module toxin, Txe/YoeB family  53.09 
 
 
87 aa  98.6  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.564887  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3569  addiction module toxin, Txe/YoeB family  48.86 
 
 
88 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00359061  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1840  hypothetical protein  51.22 
 
 
83 aa  98.2  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.182478  normal  0.185437 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2599  addiction module toxin, Txe/YoeB family  60.53 
 
 
83 aa  98.2  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2939  hypothetical protein  53.09 
 
 
84 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0312  addiction module antitoxin  51.22 
 
 
84 aa  96.3  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1700  addiction module antitoxin  52.94 
 
 
88 aa  95.5  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2537  addiction module toxin, Txe/YoeB family  48.84 
 
 
86 aa  95.9  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4121  hypothetical protein  47.13 
 
 
88 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1662  addiction module toxin, Txe/YoeB family  53.01 
 
 
84 aa  93.2  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0202081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0336  hypothetical protein  45 
 
 
82 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.689811  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16050  toxin-antitoxin system, toxin component, Txe/YoeB family  50.6 
 
 
84 aa  87.4  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5998  prevent-host-death protein:addiction module toxin, Txe/YoeB  72.55 
 
 
106 aa  86.7  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0703  addiction module toxin, Txe/YoeB family  63.08 
 
 
233 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.564313  normal  0.609374 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0408  addiction module antitoxin  47.06 
 
 
86 aa  85.5  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2573  addiction module toxin, Txe/YoeB family  46.99 
 
 
88 aa  84.7  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000405967  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1753  addiction module antitoxin  46.51 
 
 
88 aa  80.9  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.709667  normal  0.0794356 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0575  addiction module toxin, Txe/YoeB family  56.9 
 
 
58 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0412  addiction module toxin, Txe/YoeB family  56.9 
 
 
58 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2088  addiction module toxin, Txe/YoeB  43.02 
 
 
110 aa  79  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000111653  unclonable  0.0000000950728 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2431  Txe/YoeB family addiction module toxin  47.62 
 
 
91 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2479  addiction module antitoxin  54.84 
 
 
63 aa  77.8  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0199155  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2721  addiction module antitoxin  64.71 
 
 
62 aa  77  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284593  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0988  addiction module antitoxin  53.97 
 
 
63 aa  77  0.00000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4647  addiction module toxin, Txe/YoeB family  43.02 
 
 
87 aa  76.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00453645  normal  0.644511 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2532  addiction module toxin, Txe/YoeB family  41.67 
 
 
89 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0737  hypothetical protein  45.57 
 
 
88 aa  72  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000370913  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2038  addiction module antitoxin  41.67 
 
 
100 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.260803 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3884  addiction module toxin, Txe/YoeB family  40.24 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1100  addiction module toxin, Txe/YoeB  37.93 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1930  addiction module toxin, Txe/YoeB  40.62 
 
 
93 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2536  addiction module toxin, Txe/YoeB family  48.21 
 
 
81 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0231  addiction module antitoxin  38.81 
 
 
93 aa  60.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.116494  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2586  addiction module toxin, Txe/YoeB family  32.94 
 
 
93 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1659  addiction module toxin Txe/YoeB  69.7 
 
 
36 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1443  addiction module toxin, Txe/YoeB family  38.03 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.403552  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0726  addiction module toxin, Txe/YoeB family  36.05 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0706  addiction module toxin, Txe/YoeB family  34.92 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1914  addiction module toxin, Txe/YoeB family  40 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.197828  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4300  Addiction module toxin Txe/YoeB  44.44 
 
 
65 aa  42  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0118658  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1546  addiction module toxin, Txe/YoeB family  34.12 
 
 
83 aa  41.2  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>