13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0702 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0702  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  303  5.0000000000000004e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.171887  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0036  hypothetical protein  63.89 
 
 
148 aa  194  5.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0135  hypothetical protein  56.16 
 
 
148 aa  163  8e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000621154  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0043  hypothetical protein  54.11 
 
 
147 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.798492 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2314  hypothetical protein  40.26 
 
 
156 aa  114  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1850  hypothetical protein  38.41 
 
 
168 aa  101  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000113368  normal  0.143422 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1949  hypothetical protein  37.5 
 
 
136 aa  84  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.372883  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0449  hypothetical protein  29.3 
 
 
173 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000134264  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0234  hypothetical protein  24.24 
 
 
189 aa  53.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.621002 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1607  hypothetical protein  28.24 
 
 
163 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0269  hypothetical protein  28.57 
 
 
172 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.133845  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0452  hypothetical protein  22.36 
 
 
175 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0660965  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0071  hypothetical protein  23.46 
 
 
181 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233632 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>