234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0557 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0557  fructose-1,6-bisphosphatase  100 
 
 
332 aa  680    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.127763  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2207  fructose-1,6-bisphosphatase  90.94 
 
 
333 aa  630  1e-179  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000233148  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0686  fructose-1,6-bisphosphatase  90.36 
 
 
332 aa  628  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00984781  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0461  fructose-1,6-bisphosphatase  90.03 
 
 
333 aa  618  1e-176  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0602  fructose-1,6-bisphosphatase  87.31 
 
 
333 aa  600  1e-170  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1796  fructose-1,6-bisphosphatase  84.85 
 
 
333 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.88086  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1674  fructose-1,6-bisphosphatase  83.49 
 
 
332 aa  568  1e-161  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000201501  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1216  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  58.13 
 
 
345 aa  392  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.696792  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2970  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  59.08 
 
 
361 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3966  fructose-1,6-bisphosphatase  57.19 
 
 
372 aa  378  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1136  fructose-1,6-bisphosphatase  57.1 
 
 
338 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.510745  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3912  fructose-1,6-bisphosphatase  56.27 
 
 
334 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.166278  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001689  fructose-1,6-bisphosphatase type I  57.8 
 
 
338 aa  379  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0464  fructose-1,6-bisphosphatase  57.19 
 
 
334 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000776402  normal  0.875893 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3714  fructose-1,6-bisphosphatase  56.27 
 
 
334 aa  378  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.213043  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3766  fructose-1,6-bisphosphatase  57.19 
 
 
372 aa  378  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151504  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2122  fructose-1,6-bisphosphatase  57.19 
 
 
336 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00785  fructose-1,6-bisphosphatase  57.19 
 
 
338 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3621  fructose-1,6-bisphosphatase  57.19 
 
 
337 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0542  fructose-1,6-bisphosphatase  55.96 
 
 
334 aa  371  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204949  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2896  D-fructose 1,6-bisphosphatase  57.01 
 
 
346 aa  370  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00135838  normal  0.0771148 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0499  fructose-1,6-bisphosphatase  55.96 
 
 
334 aa  371  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.580096  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04100  fructose-1,6-bisphosphatase  55.08 
 
 
332 aa  364  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3762  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  55.08 
 
 
332 aa  364  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3779  fructose-1,6-bisphosphatase  55.08 
 
 
332 aa  364  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4780  fructose-1,6-bisphosphatase  55.08 
 
 
332 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.507525  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0346  fructose-1,6-bisphosphatase  55.38 
 
 
336 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.696166  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4814  fructose-1,6-bisphosphatase  55.08 
 
 
332 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4709  fructose-1,6-bisphosphatase  55.08 
 
 
332 aa  364  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4695  fructose-1,6-bisphosphatase  55.08 
 
 
332 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4801  fructose-1,6-bisphosphatase  55.08 
 
 
332 aa  364  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4684  fructose-1,6-bisphosphatase  55.08 
 
 
332 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.66845 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4485  fructose-1,6-bisphosphatase  55.08 
 
 
332 aa  364  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04064  hypothetical protein  55.08 
 
 
332 aa  364  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4852  fructose-1,6-bisphosphatase  55.08 
 
 
332 aa  364  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4835  fructose-1,6-bisphosphatase  55.08 
 
 
332 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.469676  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5751  fructose-1,6-bisphosphatase  54.77 
 
 
332 aa  363  2e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0418  fructose-1,6-bisphosphatase  54.24 
 
 
332 aa  361  1e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1248  fructose-1,6-bisphosphatase  53.05 
 
 
335 aa  356  2.9999999999999997e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3555  fructose-1,6-bisphosphatase  55.73 
 
 
337 aa  355  5.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0404  fructose-1,6-bisphosphatase  55.08 
 
 
337 aa  354  1e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10683 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1321  fructose-1,6-bisphosphatase  53.78 
 
 
337 aa  354  1e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0332934  hitchhiker  0.00400936 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02300  fructose-1,6-bisphosphatase  53.99 
 
 
339 aa  354  1e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2069  fructose-1,6-bisphosphatase  53.47 
 
 
338 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1910  fructose-1,6-bisphosphatase  54.01 
 
 
334 aa  345  6e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0900171  normal  0.235254 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4096  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  53.11 
 
 
331 aa  338  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0533  fructose-1,6-bisphosphatase  52.15 
 
 
334 aa  337  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1197  fructose-1,6-bisphosphatase  49.39 
 
 
337 aa  334  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0711065  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1243  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  52.87 
 
 
333 aa  334  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0340688  normal  0.0302273 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1040  fructose-1,6-bisphosphatase  52.42 
 
 
341 aa  333  3e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.992157  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1496  fructose-1,6-bisphosphatase  49.85 
 
 
349 aa  322  6e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000434536 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0023  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  50.97 
 
 
323 aa  318  6e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.210446  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1680  fructose-1,6-bisphosphatase  48.64 
 
 
349 aa  318  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0441  fructose-1,6-bisphosphatase  48.48 
 
 
347 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014948  normal  0.106062 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0430  fructose-1,6-bisphosphatase  48.48 
 
 
347 aa  312  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00470  fructose-bisphosphatase, putative  48.93 
 
 
350 aa  311  1e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0682  fructose-1,6-bisphosphatase  46.65 
 
 
354 aa  310  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1089  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  47.73 
 
 
358 aa  308  6.999999999999999e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3429  fructose-1,6-bisphosphatase  47.43 
 
 
349 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169976  normal  0.258531 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2335  fructose-1,6-bisphosphatase  49.24 
 
 
344 aa  305  7e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51462  Fructose-1,6-bisphosphatase  47.68 
 
 
332 aa  295  8e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30353  predicted protein  45.26 
 
 
380 aa  293  3e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.66538  normal  0.0824042 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0281  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  47.68 
 
 
336 aa  289  6e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320713  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0368  fructose-1,6-bisphosphatase  45.92 
 
 
339 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.244889  normal  0.233864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0189  fructose-1,6-bisphosphatase  45.92 
 
 
339 aa  287  2e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0209227  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0021  fructose-1,6-bisphosphatase  44.69 
 
 
335 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193201  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3065  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  44.69 
 
 
334 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740891  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1067  fructose-1,6-bisphosphatase  46.27 
 
 
335 aa  282  5.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.641395  normal  0.908963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2250  fructose-1,6-bisphosphatase  44.78 
 
 
339 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.523394  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3026  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  44.38 
 
 
358 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00242569  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2760  fructose-1,6-bisphosphatase  44.48 
 
 
339 aa  280  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3263  fructose-1,6-bisphosphatase  46.75 
 
 
335 aa  279  5e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0139597  hitchhiker  0.00000000837949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0508  fructose-1,6-bisphosphatase  45.54 
 
 
335 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3795  fructose-1,6-bisphosphatase  45.65 
 
 
337 aa  278  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1859  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  45.02 
 
 
334 aa  277  2e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000101477  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0469  fructose-1,6-bisphosphatase  46.69 
 
 
338 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3031  fructose-1,6-bisphosphatase  46.69 
 
 
338 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2618  fructose-1,6-bisphosphatase  46.69 
 
 
338 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.36  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0990  fructose-1,6-bisphosphatase  46.69 
 
 
338 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2925  fructose-1,6-bisphosphatase  46.69 
 
 
338 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2987  fructose-1,6-bisphosphatase  46.69 
 
 
338 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0157  fructose-1,6-bisphosphatase  46.69 
 
 
338 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1604  fructose-1,6-bisphosphatase  45.76 
 
 
338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0875  fructose-1,6-bisphosphatase  43.71 
 
 
338 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0821253  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0973  fructose-1,6-bisphosphatase  45.79 
 
 
337 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.798772  normal  0.126092 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0535  fructose-1,6-bisphosphatase  45.79 
 
 
337 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115593  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1014  fructose-1,6-bisphosphatase  45.79 
 
 
337 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32393  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2381  fructose-1,6-bisphosphatase  45.79 
 
 
337 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.881144 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1149  fructose-1,6-bisphosphatase  45.34 
 
 
335 aa  271  8.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.191646  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2266  fructose-1,6-bisphosphatase  45.09 
 
 
338 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.014374  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0889  fructose-1,6-bisphosphatase  45.48 
 
 
339 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.138169  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0084  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  45.23 
 
 
337 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3755  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  44.28 
 
 
365 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1586  fructose-1,6-bisphosphatase  45.34 
 
 
335 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0877  fructose-1,6-bisphosphatase  45.48 
 
 
339 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0798323  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4125  fructose-1,6-bisphosphatase  45.17 
 
 
337 aa  268  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00362057  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2319  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  44.92 
 
 
338 aa  268  7e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.514677  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2577  fructose-1,6-bisphosphatase  45.34 
 
 
337 aa  268  8e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.157967 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1511  D-fructose 1,6-bisphosphatase  45.86 
 
 
365 aa  268  8e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422669  decreased coverage  0.0000800022 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03469  fructose-1,6-bisphosphatase  45.05 
 
 
336 aa  268  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>