17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0190 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0190  F0F1 ATP synthase subunit B'  100 
 
 		 141 aa  272  9e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.453831  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0137  F0F1 ATP synthase subunit B'  55.32 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.725009  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0109  F0F1 ATP synthase subunit B'  54.61 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.72895  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0097  F0F1 ATP synthase subunit B'  54.61 
 
 		 141 aa  131  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1733  F0F1 ATP synthase subunit B'  39.86 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0912  F0F1 ATP synthase subunit B'  37.68 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000395011  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1530  F0F1 ATP synthase subunit B'  40.88 
 
 		 140 aa  96.7  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.283854  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0510  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  36.96 
 
 		 140 aa  93.6  9e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0682  ATP synthase subunit B  41.13 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1408  F0F1 ATP synthase subunit B'  34.78 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  27.27 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  34.78 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2622  F0F1 ATP synthase subunit B'  34.43 
 
 		 143 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  21.43 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2614  F0F1 ATP synthase subunit B'  32.86 
 
 		 163 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.434819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2717  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.48 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3386  F0F1 ATP synthase subunit B'  31.48 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000213894  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>