240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_t32 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_t32  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0011176  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0020  tRNA-Arg  97.3 
 
 		 74 bp  131  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0041  tRNA-Arg  96 
 
 		 77 bp  125  2e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000324571  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0026  tRNA-Arg  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155557  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0014  tRNA-Arg  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0054104  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0048  tRNA-Arg  93.06 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00527947  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0605047  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0030  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.238826  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0179  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0080  tRNA-Arg  93.65 
 
 		 74 bp  93.7  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0070  tRNA-Arg  93.65 
 
 		 74 bp  93.7  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0135947  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0063  tRNA-Arg  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.257054  normal  0.817877 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0020  tRNA-Arg  93.65 
 
 		 74 bp  93.7  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0062  tRNA-Arg  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0023  tRNA-Arg  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.157994  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0111  tRNA-Arg  93.65 
 
 		 74 bp  93.7  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0050  tRNA-Arg  93.65 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000344943  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0022  tRNA-Arg  90.28 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000027529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0007  tRNA-Arg  89.04 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0847038  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0006  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.652554  normal  0.867561 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0006  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0019  tRNA-Arg  89.86 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0224429  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5664  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000049458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5694  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000635784  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5726  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000859141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5732  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 79 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000219464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 80 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000143078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000847547  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000123447  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 80 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000523953  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.353058  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000201078  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 80 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000012583  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Arg-5  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000407513  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5672  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000112746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000072092  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-2  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000500778  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0133  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000990226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0101  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 79 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00157662  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4571  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 79 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000605128  normal  0.110688 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0024  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0232798  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0299  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000767893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5028  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 79 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000552339  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0860  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 79 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000046411  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5639  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 79 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.109335  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0098  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0218  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 79 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000264905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5044  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0051  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000001938  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0024  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0223361  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0100  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00184606  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0785  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 79 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.40314e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4997  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 79 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0277  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0051  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000784073  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5813  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 79 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0137  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00346099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0104  tRNA-Arg  89.55 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000527432  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0009  tRNA-Arg  89.19 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0037  tRNA-Arg  87.67 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678102  normal  0.176002 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0053  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000000376557  hitchhiker  8.69297e-22 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0084  tRNA-Arg  89.06 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000144766  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0032  tRNA-Arg  89.06 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0044  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0044  tRNA-Arg  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0007  tRNA-Arg  87.84 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0065  tRNA-Arg  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0059  tRNA-Arg  89.23 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.673271  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0057  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.783183  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0057  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32045  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0056  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0061  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381329 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0009  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00118273  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0054  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0008  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119735  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0007  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0055  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0007  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.818817  hitchhiker  0.0000144488 
 
 
-
 
NC_002950  PGt25  tRNA-Arg  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.552192 
 
 
-
 
NC_002950  PGt26  tRNA-Arg  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.546843 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0014  tRNA-Arg  86.57 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000388984  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0056  tRNA-Arg  86.57 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0056  tRNA-Arg  86.57 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.771364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0014  tRNA-Arg  86.57 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000281617  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0039  tRNA-Arg  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0291069  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0045  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000178577  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0065  tRNA-Arg  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.68192e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0038  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.427754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0009  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.190028  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0005  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134244  hitchhiker  0.00821182 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0041  tRNA-Arg  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0053  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0006  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0003  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000378947  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0077  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000716248  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0080  tRNA-Arg  86.15 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000233743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>