15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0011 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0011  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.986898  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0077  hypothetical protein  63.13 
 
 
203 aa  284  5.999999999999999e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0082  hypothetical protein  61.03 
 
 
203 aa  258  4e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0981186  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2683  hypothetical protein  57.44 
 
 
203 aa  249  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0074  hypothetical protein  56.06 
 
 
203 aa  244  4.9999999999999997e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0118  hypothetical protein  53.03 
 
 
203 aa  238  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0095  hypothetical protein  43.94 
 
 
200 aa  190  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000118998  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0187  hypothetical protein  30.5 
 
 
225 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2738  hypothetical protein  30.5 
 
 
207 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0239  hypothetical protein  27.86 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0273  hypothetical protein  28 
 
 
207 aa  92.8  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2352  hypothetical protein  29 
 
 
203 aa  91.3  9e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2003  hypothetical protein  28.28 
 
 
200 aa  87.8  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2726  hypothetical protein  27.32 
 
 
207 aa  85.5  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0120  hypothetical protein  27.67 
 
 
210 aa  82  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>