47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2179 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2179  acetyltransferase  100 
 
 
151 aa  307  4e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00330614  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  66.67 
 
 
151 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3382  acetyltransferase  40.43 
 
 
153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.054841  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3147  acetyltransferase  39.01 
 
 
152 aa  105  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000022061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3383  acetyltransferase, GNAT family  38.3 
 
 
153 aa  104  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0909187  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3057  acetyltransferase  38.3 
 
 
153 aa  104  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000438891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3163  acetyltransferase  38.3 
 
 
153 aa  103  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.036756  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3412  acetyltransferase  38.3 
 
 
153 aa  103  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3357  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  44.37 
 
 
153 aa  103  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3382  acetyltransferase, GNAT family  37.86 
 
 
164 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1869  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  45.45 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3085  GCN5-related N-acetyltransferase  41.22 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00716598  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2129  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 
152 aa  92  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2271  GCN5-related N-acetyltransferase  33.58 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1979  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 
160 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000336011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2969  GCN5-related N-acetyltransferase  28.91 
 
 
155 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.971848 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4387  GCN5-related N-acetyltransferase  23.29 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2853  GCN5-related N-acetyltransferase  28.7 
 
 
166 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.391002 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0749  GCN5-related N-acetyltransferase  25.58 
 
 
179 aa  49.7  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.743361  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3659  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 
143 aa  47.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0963  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.29 
 
 
157 aa  47.4  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2707  acetyltransferase, GNAT family  30.1 
 
 
159 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.343718  normal  0.29302 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1249  acetyltransferase  30.1 
 
 
159 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.348752  normal  0.648372 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1390  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.68 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.484383  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1714  GCN5-related N-acetyltransferase  29.13 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.493786  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  28.57 
 
 
151 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1990  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  28.44 
 
 
160 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2992  GCN5-related protein N-acetyltransferase  24.81 
 
 
179 aa  45.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0003  GCN5-related N-acetyltransferase  27.41 
 
 
320 aa  44.7  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1148  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.23 
 
 
145 aa  44.3  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2507  GCN5-related N-acetyltransferase  26.23 
 
 
166 aa  44.3  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0868  ribosomal-protein-S18-alanine acetyltransferase  30.23 
 
 
145 aa  44.3  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2848  GCN5-related N-acetyltransferase  23.08 
 
 
161 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108205  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1478  GCN5-related N-acetyltransferase  26.77 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.147785  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2597  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.79 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133462  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0687  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.33 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0691  GCN5-related N-acetyltransferase  23.71 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1332  GCN5-related N-acetyltransferase  29.46 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10971  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.65 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0263282  normal  0.176049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1525  GCN5-related N-acetyltransferase  25.58 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.766233 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001152  histone acetyltransferase HPA2  25.49 
 
 
151 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000449309  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28000  acetyltransferase (GNAT) family protein  22.05 
 
 
175 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0943003  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4775  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  28.71 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108086 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2831  GCN5-related N-acetyltransferase  22.61 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.088011 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1857  GCN5-related N-acetyltransferase  29.49 
 
 
345 aa  40.8  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.873376 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0335  acetyltransferase  28.92 
 
 
184 aa  40.4  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.793507  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0958  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.41 
 
 
173 aa  40  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.452906 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>