13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1629 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1629  hypothetical protein  100 
 
 		 506 aa  1040    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2175  hypothetical protein  22.64 
 
 		 416 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.559227  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06982  hypothetical protein  28.77 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4722  hypothetical protein  24.73 
 
 		 694 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224738  normal  0.0942649 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0016  hypothetical protein  28.68 
 
 		 638 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490672  unclonable  0.000000381885 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0008  hypothetical protein  28.68 
 
 		 638 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0559853  normal  0.0972457 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0010  hypothetical protein  28.68 
 
 		 638 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0008  hypothetical protein  28.68 
 
 		 638 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1857  hypothetical protein  26.71 
 
 		 504 aa  48.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3363  hypothetical protein  23.45 
 
 		 329 aa  44.3  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0018  hypothetical protein  27.66 
 
 		 605 aa  44.3  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1340  hypothetical protein  26.81 
 
 		 170 aa  43.9  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.317438  normal  0.416506 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0375  hypothetical protein  30.61 
 
 		 488 aa  43.5  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>