22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1433 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1699  hypothetical protein  98.34 
 
 		 421 aa  816    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000791794  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1433  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  829    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2675  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0980951  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0026  transcriptional regulator, XRE family  26.88 
 
 		 435 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0122456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1434  helix-turn-helix domain-containing protein  38.57 
 
 		 433 aa  51.2  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.673914  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3656  putative transcriptional regulator/TPR domain protein  37.5 
 
 		 421 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2600  transcriptional regulator  24.37 
 
 		 423 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00128459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2570  hypothetical protein  43.1 
 
 		 430 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0258744  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4209  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 194 aa  47.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1242  XRE family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 432 aa  46.6  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0223131 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0510  transcriptional activator (transcriptional regulator)  21.88 
 
 		 423 aa  47  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.924451  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5721  hypothetical protein  40 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0380907  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0508  transcriptional activator (transcriptional regulator)  21.66 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0636  transcriptional activator  23.03 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0512  XRE family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0654  DNA-binding protein  23.42 
 
 		 424 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000206988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2397  TPR repeat-containing protein  21.51 
 
 		 571 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1558  transcriptional regulator  29.22 
 
 		 403 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0725  transcriptional activator  24.38 
 
 		 419 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4702  transcriptional activator  23.03 
 
 		 419 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00084826 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1567  transcriptional regulator  29.22 
 
 		 403 aa  43.5  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0668  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 424 aa  43.1  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>