18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1005 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1005  glycerol dehydratase, beta subunit  100 
 
 
188 aa  380  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.295335  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1174  coenzyme B12-dependent glycerol dehydratase, medium subunit  99.47 
 
 
188 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.145857  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1032  dehydratase medium subunit  70.95 
 
 
224 aa  251  3e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00834098  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1952  dehydratase, medium subunit  65.56 
 
 
229 aa  239  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2282  propanediol utilization dehydratase, medium subunit  63.43 
 
 
222 aa  227  8e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2377  propanediol utilization: dehydratase, medium subunit  64 
 
 
224 aa  224  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2218  propanediol utilization: dehydratase, medium subunit  64 
 
 
224 aa  224  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2264  propanediol dehydratase medium subunit  64 
 
 
224 aa  224  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.140255 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2211  propanediol dehydratase medium subunit  64 
 
 
224 aa  224  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2164  propanediol dehydratase medium subunit  64 
 
 
224 aa  224  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0285  dehydratase medium subunit  59.68 
 
 
197 aa  223  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1746  dehydratase, medium subunit  63.22 
 
 
236 aa  215  3e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5563  glycerol dehydratase  45.21 
 
 
746 aa  147  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.811495  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1245  glycerol dehydratase  46.93 
 
 
746 aa  146  2e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00307379  decreased coverage  4.39875e-06 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5335  glycerol dehydratase  45.25 
 
 
739 aa  144  8e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4954  glycerol dehydratase  45.25 
 
 
739 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5042  glycerol dehydratase  45.25 
 
 
739 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.359522  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1949  hypothetical protein  36.96 
 
 
121 aa  47.4  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>