39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL04160 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006681  CNL04160  retrotransposon nucleocapsid protein, putative  100 
 
 		 1414 aa  2920    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0468988  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03140  retrotransposon nucleocapsid protein, putative  30.46 
 
 		 1484 aa  452  1e-125  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02670  conserved hypothetical protein  31.27 
 
 		 1530 aa  380  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.279256  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10649  conserved hypothetical protein  31.16 
 
 		 1562 aa  378  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  unclonable  0.000556846  hitchhiker  0.00000000000679283 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10256  conserved hypothetical protein  27.6 
 
 		 1311 aa  324  9.000000000000001e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.16762  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00376  conserved hypothetical protein  26.45 
 
 		 1376 aa  234  6e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.624297  normal  0.25549 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05470  conserved hypothetical protein  32.88 
 
 		 608 aa  228  4e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.339173 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02714  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 		 944 aa  207  8e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.29896 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05254  hypothetical protein  30.73 
 
 		 1010 aa  187  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10846  conserved hypothetical protein  30.96 
 
 		 1307 aa  174  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.342615  normal  0.0851199 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07845  conserved hypothetical protein  35.8 
 
 		 533 aa  162  4e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413766  normal  0.0853676 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08576  conserved hypothetical protein  24.76 
 
 		 1451 aa  159  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00000000167609 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05253  conserved hypothetical protein  32.39 
 
 		 568 aa  139  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0683124  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05471  conserved hypothetical protein  33.8 
 
 		 276 aa  105  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.507919  normal  0.280227 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06966  conserved hypothetical protein  34.4 
 
 		 356 aa  102  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.912995 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02616  conserved hypothetical protein  25.39 
 
 		 768 aa  96.3  4e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00994417 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06968  conserved hypothetical protein  38.46 
 
 		 722 aa  89.7  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.991348  normal  0.860423 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02713  conserved hypothetical protein  33.18 
 
 		 345 aa  87.8  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.232747  normal  0.445875 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10632  conserved hypothetical protein  34.68 
 
 		 356 aa  84.3  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0128758  unclonable  9.48563e-19 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03471  conserved hypothetical protein  32.7 
 
 		 345 aa  84.3  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05095  conserved hypothetical protein  31.73 
 
 		 221 aa  66.2  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0925556  unclonable  7.92157e-19 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05065  conserved hypothetical protein  34.09 
 
 		 109 aa  62.4  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000000661141 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02530  hypothetical protein  75.86 
 
 		 195 aa  53.5  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.857331  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2179  transposase  29.09 
 
 		 325 aa  51.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2728  putative transposase  29.09 
 
 		 441 aa  51.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2493  transposase, putative  29.09 
 
 		 325 aa  51.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2250  putative transposase  29.09 
 
 		 333 aa  51.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2194  putative transposase  29.09 
 
 		 329 aa  51.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0917  transposase  29.09 
 
 		 327 aa  51.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0120  hypothetical protein  29.09 
 
 		 497 aa  51.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1782  putative integrase  28.76 
 
 		 325 aa  50.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1378  putative integrase  28.76 
 
 		 325 aa  50.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00372186  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00536  conserved hypothetical protein  37.31 
 
 		 86 aa  49.3  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1280  integrase catalytic subunit  24.34 
 
 		 463 aa  48.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.722165  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0344  Integrase catalytic region  28.48 
 
 		 325 aa  47.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000845152  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3709  Integrase catalytic region  28.48 
 
 		 325 aa  47.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  0.108327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1251  integrase catalytic subunit  24.34 
 
 		 333 aa  47  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1301  integrase catalytic subunit  24.34 
 
 		 321 aa  47  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.117909 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4152  transposase ISRme5 (copy d)  24.34 
 
 		 321 aa  47  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.29962  normal  0.334182 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>