18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0004 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0004  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  233  9e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.408251  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0030  hypothetical protein  98.23 
 
 		 113 aa  230  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.593403  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0008  hypothetical protein  74.07 
 
 		 111 aa  163  6.9999999999999995e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2873  hypothetical protein  45.45 
 
 		 131 aa  90.1  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3243  hypothetical protein  39.77 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984975  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3623  hypothetical protein  40.91 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.599999  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0716  monoheme cytochrome c, putative  35.51 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0008  monoheme cytochrome c, putative  34.51 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0100224 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0008  monoheme cytochrome c, putative  34.26 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0008  monoheme cytochrome c, putative  34.51 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000351615 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6938  hypothetical protein  40.66 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1174  hypothetical protein  37.5 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000759972 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0980  hypothetical protein  34 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00330636  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2982  hypothetical protein  34.67 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4082  hypothetical protein  42.31 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0917  hypothetical protein  40.38 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606921  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4892  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  27.62 
 
 		 218 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0083  cytochrome c oxidoreductase subunit B  32.63 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000280154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>