18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0004 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0004  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  233  9e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.408251  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0030  hypothetical protein  98.23 
 
 
113 aa  230  4e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.593403  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0008  hypothetical protein  74.07 
 
 
111 aa  163  7e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2873  hypothetical protein  45.45 
 
 
131 aa  90.1  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3243  hypothetical protein  39.77 
 
 
131 aa  75.1  3e-13  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984975  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3623  hypothetical protein  40.91 
 
 
135 aa  74.7  4e-13  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.599999  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0716  monoheme cytochrome c, putative  35.51 
 
 
127 aa  73.9  8e-13  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0008  monoheme cytochrome c, putative  34.51 
 
 
127 aa  71.2  4e-12  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0100224 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0008  monoheme cytochrome c, putative  34.26 
 
 
127 aa  70.1  9e-12  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0008  monoheme cytochrome c, putative  34.51 
 
 
127 aa  70.1  9e-12  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  3.51615e-07 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6938  hypothetical protein  40.66 
 
 
183 aa  68.6  3e-11  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1174  hypothetical protein  37.5 
 
 
126 aa  67.4  6e-11  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  7.59972e-06 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0980  hypothetical protein  34 
 
 
129 aa  65.9  2e-10  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00330636  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2982  hypothetical protein  34.67 
 
 
116 aa  48.9  2e-05  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4082  hypothetical protein  42.31 
 
 
121 aa  48.1  4e-05  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0917  hypothetical protein  40.38 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606921  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4892  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  27.62 
 
 
218 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0083  cytochrome c oxidoreductase subunit B  32.63 
 
 
92 aa  40.4  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  2.80154e-12  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>