39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0096 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0096  transporter, Ni2+-Co2+ transporter  100 
 
 		 505 aa  1036    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00355357  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1792  tRNA pseudouridine synthase B  56.95 
 
 		 497 aa  556  1e-157  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1730  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  40.3 
 
 		 513 aa  369  1e-101  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1499  transporter, Ni2+-Co2+ transporter  36.46 
 
 		 490 aa  317  4e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.844578  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1272  high-affinity nickel-transporter  29.39 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000384765  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0439  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  29.39 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000891132  hitchhiker  0.0000143481 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1164  Ni2+-Co2+ transporter (NiCoT) family protein  29.39 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1753  high-affinity nickel-transporter  27.59 
 
 		 329 aa  62.4  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3041  high-affinity nickel-transporter  27.09 
 
 		 357 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.167253  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3631  high-affinity nickel-transporter  25.73 
 
 		 340 aa  59.3  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0473418  normal  0.881878 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1234  high-affinity nickel-transporter  25.4 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1480  high-affinity nickel-transporter  25.22 
 
 		 247 aa  55.5  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0391  high-affinity nickel-transporter  25.45 
 
 		 342 aa  55.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1929  high-affinity nickel-transporter  23.74 
 
 		 314 aa  55.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.495072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3393  high-affinity nickel-transporter  26.53 
 
 		 358 aa  54.3  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0166136 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1096  high-affinity nickel-transporter  24.65 
 
 		 345 aa  53.5  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.767185  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0284  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like  23.87 
 
 		 197 aa  53.5  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0329928  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3692  high-affinity nickel-transporter  24.72 
 
 		 358 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1079  permease  25.61 
 
 		 335 aa  50.1  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0887396  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0116  hypothetical protein  25.94 
 
 		 293 aa  49.3  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27353  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2759  high-affinity nickel-transporter  25.59 
 
 		 351 aa  48.9  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0674  high-affinity nickel-transporter  21.58 
 
 		 372 aa  48.5  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00986195 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2775  high-affinity nickel-transporter  25 
 
 		 337 aa  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0316  high-affinity nickel-transporter  24.46 
 
 		 349 aa  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0121429 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4249  high-affinity nickel-transporter  25.63 
 
 		 367 aa  47.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.470943  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3811  hypothetical protein  24 
 
 		 389 aa  48.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.397121  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3421  hypothetical protein  24.42 
 
 		 353 aa  47  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1975  putative lipoprotein  21.97 
 
 		 220 aa  47  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0291  high-affinity nickel-transporter  23.53 
 
 		 319 aa  47  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.413944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2926  high-affinity nickel-transporter  23.61 
 
 		 328 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2792  high-affinity nickel-transporter  23.61 
 
 		 328 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2751  high-affinity nickel-transporter  23.04 
 
 		 328 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2047  high-affinity nickel-transporter  21.4 
 
 		 249 aa  46.6  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.035095  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2976  high-affinity nickel-transporter  22.35 
 
 		 342 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2706  high-affinity nickel-transporter  23.04 
 
 		 328 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.629931  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2813  high-affinity nickel-transporter  23.61 
 
 		 328 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.774506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0285  ABC-type uncharacterized transport system permease component-like  24.27 
 
 		 366 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0371568  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1404  hypothetical protein  20.98 
 
 		 225 aa  45.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.384967  normal  0.0196472 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2202  high-affinity nickel-transporter  24.74 
 
 		 323 aa  44.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132612  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>