40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_24730 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_24730  streptomycin 6-kinase  100 
 
 
312 aa  608  1e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.320785  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2714  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  34.8 
 
 
298 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.148497 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1892  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  34.81 
 
 
303 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.565098  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3746  kinase  33.12 
 
 
295 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.807756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5378  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  31.74 
 
 
307 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0942193  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2219  6-kinase  31.38 
 
 
307 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000195606  decreased coverage  0.000000830578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0803  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  31.8 
 
 
285 aa  93.2  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2285  aminoglycoside phosphotransferase  32.29 
 
 
329 aa  93.2  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0261  6-kinase  32.25 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1422  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  31.6 
 
 
373 aa  90.1  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000015998 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4087  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  34.04 
 
 
311 aa  90.1  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1410  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  28.62 
 
 
331 aa  82.4  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.189739  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1604  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  28.92 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0859815  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4430  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  30.04 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.796967  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3440  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  27.84 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  0.0646314 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2188  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  30.43 
 
 
300 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4253  6-kinase  29.96 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3432  streptomycin 3''-kinase  30 
 
 
273 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0514  aminoglycoside phosphotransferase family protein  23.92 
 
 
323 aa  55.5  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3891  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  27.41 
 
 
271 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.571465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2457  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  29.17 
 
 
271 aa  53.9  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40450  streptomycin 3''-phosphotransferase  29.86 
 
 
273 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30370  streptomycin 6-kinase  30.2 
 
 
326 aa  52.8  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2227  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  26.14 
 
 
284 aa  52.8  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000351208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3035  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  29.19 
 
 
264 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1665  hydroxyurea phosphotransferase  21.71 
 
 
468 aa  51.2  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1244  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  31.16 
 
 
272 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761762  normal  0.361729 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3331  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  30.1 
 
 
300 aa  49.7  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0145653 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35670  streptomycin 6-kinase  27.7 
 
 
293 aa  48.9  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2795  3''-kinase  28.37 
 
 
265 aa  46.2  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.342668 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2501  3''-kinase  26.09 
 
 
277 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2987  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  27.45 
 
 
266 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0510787 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5439  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  28.86 
 
 
279 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4830  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  28.86 
 
 
279 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.975456 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5423  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  28.86 
 
 
279 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944059  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0129  aminoglycoside resistance protein B  27.94 
 
 
276 aa  43.1  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.974008  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5338  streptomycin phosphotransferase  27.94 
 
 
278 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1571  aminoglycoside resistance protein B  27.94 
 
 
281 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.078076  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0045  streptomycin resistance protein StrB  27.94 
 
 
276 aa  42.7  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2670  aminoglycoside/hydroxyurea antibiotic resistance kinase  27.94 
 
 
276 aa  42.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.02986  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>