17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2748 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2748  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  221  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1663  hypothetical protein  45.79 
 
 		 170 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1723  hypothetical protein  45.79 
 
 		 110 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.034486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2336  hypothetical protein  44.95 
 
 		 108 aa  90.1  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.110773  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1659  hypothetical protein  43.93 
 
 		 110 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2114  putative cytoplasmic protein  41.96 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000392621  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2233  hypothetical protein  41.07 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0210467  normal  0.784875 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2346  hypothetical protein  41.07 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000082368  hitchhiker  0.00160333 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2169  putative cytoplasmic protein  41.07 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000813161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2434  hypothetical protein  42.59 
 
 		 108 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1616  hypothetical protein  46.48 
 
 		 71 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.396977  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1790  hypothetical protein  49.21 
 
 		 62 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5116  hypothetical protein  34.51 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.221736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4583  hypothetical protein  34.51 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2476  hypothetical protein  28.07 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2625  hypothetical protein  28.95 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.050449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0239  protein of unknown function DUF1493  30.65 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>