16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA2996 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2996  hypothetical protein  100 
 
 
120 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0547  hypothetical protein  55.56 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0065  hypothetical protein  56.18 
 
 
141 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3255  glycine cleavage system T protein  96.97 
 
 
584 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2989  hypothetical protein  69.77 
 
 
57 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1858  hypothetical protein  64.41 
 
 
211 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000275455  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1062  hypothetical protein  57.63 
 
 
792 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3997  transcriptional regulator TrmB  65.85 
 
 
280 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182291  normal  0.0312919 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4996  hypothetical protein  48.86 
 
 
302 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3379  hypothetical protein  40.51 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0691686  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3563  AAA family ATPase  63.16 
 
 
1122 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0287  hypothetical protein  40.51 
 
 
138 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3345  hypothetical protein  43.33 
 
 
108 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2313  hypothetical protein  30.16 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5780  hypothetical protein  51.22 
 
 
355 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000190201  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1403  RNA-binding protein  48.72 
 
 
49 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>