44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7619 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7619  50S ribosomal protein L32P  100 
 
 
46 aa  94.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00560447  normal  0.375625 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0527  50S ribosomal protein L32  95.65 
 
 
60 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0514  50S ribosomal protein L32  91.3 
 
 
60 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0311  50S ribosomal protein L32  91.3 
 
 
60 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0499  50S ribosomal protein L32  89.13 
 
 
60 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00950666 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0625  50S ribosomal protein L32  93.18 
 
 
61 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19517  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5115  50S ribosomal protein L32  86.96 
 
 
62 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.637 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3774  50S ribosomal protein L32  86.96 
 
 
62 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3466  50S ribosomal protein L32  86.96 
 
 
62 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.357647  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0497  50S ribosomal protein L32  93.18 
 
 
61 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3664  50S ribosomal protein L32  86.96 
 
 
62 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416645  normal  0.271996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3111  50S ribosomal protein L32  88.64 
 
 
61 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5277  50S ribosomal protein L32  88.64 
 
 
61 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5638  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3426  50S ribosomal protein L32  82.61 
 
 
60 aa  84.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5920  50S ribosomal protein L32  88.64 
 
 
61 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3825  50S ribosomal protein L32  80.43 
 
 
61 aa  83.2  1e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.828831  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4153  50S ribosomal protein L32  80.43 
 
 
61 aa  83.2  1e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.867327 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0122  50S ribosomal protein L32  80.43 
 
 
61 aa  82  2e-15  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3119  50S ribosomal protein L32  78.26 
 
 
61 aa  82.8  2e-15  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1128  ribosomal protein L32  80 
 
 
59 aa  81.6  3e-15  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.798956  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4342  50S ribosomal protein L32  78.26 
 
 
61 aa  81.6  4e-15  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1775  50S ribosomal protein L32  80 
 
 
59 aa  81.6  4e-15  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1710  50S ribosomal protein L32  80 
 
 
59 aa  81.6  4e-15  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.142223  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0425  50S ribosomal protein L32  79.55 
 
 
63 aa  79.7  1e-14  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.311335 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0820  50S ribosomal protein L32  77.78 
 
 
62 aa  79.3  2e-14  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177127 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1411  50S ribosomal protein L32P  71.11 
 
 
60 aa  75.5  2e-13  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.361798  hitchhiker  9.64737e-06 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1559  ribosomal protein L32  72.73 
 
 
60 aa  74.3  5e-13  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2764  ribosomal protein L32  64.44 
 
 
46 aa  66.6  1e-10  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  1.22605e-05 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2467  ribosomal protein L32  51.11 
 
 
61 aa  51.6  4e-06  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  1.35728e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0633  ribosomal protein L32  52.38 
 
 
63 aa  49.7  1e-05  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3599  ribosomal protein L32  47.5 
 
 
59 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1665  50S ribosomal protein L32  46.51 
 
 
61 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0871064  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1420  50S ribosomal protein L32  46.34 
 
 
59 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.640468  normal  0.982205 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3291  50S ribosomal protein L32  43.9 
 
 
67 aa  43.5  0.0009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.366938 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2368  50S ribosomal protein L32  46.34 
 
 
59 aa  43.5  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0271  50S ribosomal protein L32  43.9 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.750719  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2129  ribosomal protein L32  51.16 
 
 
59 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120071  normal  0.0237649 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0743  ribosomal protein L32  44.44 
 
 
63 aa  41.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1669  ribosomal protein S32  46.67 
 
 
65 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.545135  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3554  50S ribosomal protein L32  41.46 
 
 
59 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1237  50S ribosomal protein L32  42.22 
 
 
59 aa  41.6  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.409262  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1910  50S ribosomal protein L32  43.9 
 
 
68 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2614  50S ribosomal protein L32  43.9 
 
 
68 aa  40  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1272  50S ribosomal protein L32  43.9 
 
 
68 aa  40  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.165805 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>