39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6235 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6235  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  174  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4114  hypothetical protein  79.55 
 
 		 88 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316691  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1936  hypothetical protein  84.09 
 
 		 88 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1346  hypothetical protein  70.45 
 
 		 89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.093057  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1959  hypothetical protein  60.67 
 
 		 91 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.655649  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6437  hypothetical protein  65.91 
 
 		 88 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.175327 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2423  hypothetical protein  56.82 
 
 		 94 aa  110  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0012  hypothetical protein  62.5 
 
 		 88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000302425 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5849  hypothetical protein  64.77 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.449702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1979  Protein of unknown function DUF2277  64 
 
 		 89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.367079  normal  0.383603 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1500  Protein of unknown function DUF2277  60 
 
 		 88 aa  103  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036571 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5022  hypothetical protein  61.54 
 
 		 93 aa  103  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4100  hypothetical protein  64.77 
 
 		 90 aa  100  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2124  hypothetical protein  63.64 
 
 		 95 aa  100  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0806106  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1784  hypothetical protein  52.81 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.672512 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23290  hypothetical protein  62.5 
 
 		 90 aa  98.2  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3874  hypothetical protein  58.67 
 
 		 90 aa  97.1  7e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0020035 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1521  hypothetical protein  61.8 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0150992  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0782  hypothetical protein  59.55 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2050  hypothetical protein  61.36 
 
 		 89 aa  90.5  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3228  hypothetical protein  55.68 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0790385  hitchhiker  0.00000720157 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2833  hypothetical protein  53.01 
 
 		 100 aa  87.8  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1700  hypothetical protein  52.56 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00489273  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1627  hypothetical protein  53.85 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0246366  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3637  Protein of unknown function DUF2277  63.38 
 
 		 89 aa  80.9  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0703  hypothetical protein  60.67 
 
 		 90 aa  79  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.394732  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12900  hypothetical protein  53.97 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3498  Protein of unknown function DUF2277  50.79 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1910  Protein of unknown function DUF2277  47.62 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0873  hypothetical protein  51.47 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1878  hypothetical protein  44.44 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3867  Protein of unknown function DUF2277  58.54 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1986  hypothetical protein  53.97 
 
 		 87 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.664421  normal  0.484535 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12843  hypothetical protein  51.43 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9020  hypothetical protein  51.39 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.601341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3607  hypothetical protein  52.78 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2135  hypothetical protein  52.86 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0178676 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2072  hypothetical protein  52.86 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00877589  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2089  hypothetical protein  52.86 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>