27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_42010 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_42010  hypothetical protein  100 
 
 		 81 aa  168  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0423  proteic killer protein, putative  57.14 
 
 		 92 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3644  plasmid maintenance system killer  57.14 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.018062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5381  plasmid maintenance system killer  51.43 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0821109  hitchhiker  0.0023513 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2470  plasmid maintenance system killer  55.56 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3084  plasmid maintenance system killer  55.56 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3242  plasmid maintenance system killer  48.57 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0235263  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1143  proteic killer suppression protein  44.29 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0404  proteic killer suppression protein  44.29 
 
 		 93 aa  66.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0438  plasmid maintenance system killer  49.18 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.275617  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0360  plasmid maintenance system killer  44.29 
 
 		 93 aa  65.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6434  plasmid maintenance system killer  53.57 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4450  plasmid maintenance system killer  47.14 
 
 		 92 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0570  plasmid maintenance system killer  52.46 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3837  plasmid maintenance system killer  41.27 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2890  plasmid maintenance system killer  45.76 
 
 		 92 aa  57  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.320919  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0088  plasmid maintenance system killer protein  38.36 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.167827  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0090  plasmid maintenance system killer  38.36 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6999  plasmid maintenance system killer  34.43 
 
 		 94 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1591  plasmid maintenance system killer  41.38 
 
 		 92 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0593652  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2424  plasmid maintenance system killer  44.83 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1454  plasmid maintenance system killer  40.85 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.046849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2424  plasmid maintenance system killer  44.83 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228875  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2183  plasmid maintenance system killer  31.75 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454111  unclonable  0.000000258126 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1124  plasmid maintenance system killer  31.75 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000991255  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1106  plasmid maintenance system killer  41.67 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.458841  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2525  plasmid maintenance system killer  31.51 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0385554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>