14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_00980 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_00980  hypothetical protein  100 
 
 
68 aa  127  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0146  hypothetical protein  74.24 
 
 
67 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0075  hypothetical protein  63.64 
 
 
67 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.356235  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0123  hypothetical protein  66.67 
 
 
67 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0121  hypothetical protein  65.15 
 
 
67 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.932988  normal  0.0212568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0126  hypothetical protein  63.64 
 
 
67 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.831576 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0184  hypothetical protein  69.7 
 
 
69 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01330  hypothetical protein  69.7 
 
 
69 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861282  normal  0.982604 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0066  hypothetical protein  53.85 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0040  DNA polymerase A  45 
 
 
82 aa  51.6  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.105525  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0188  putative transmembrane protein  41.38 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04024  hypothetical protein  36.92 
 
 
72 aa  45.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0475  hypothetical protein  39.13 
 
 
67 aa  40  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0451  hypothetical protein  39.13 
 
 
67 aa  40  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>