More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4027 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_4027  cell division ATP-binding protein  100 
 
 
207 aa  407  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3572  cell division ATP-binding protein FtsE  89.37 
 
 
219 aa  374  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal  0.091896 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3865  cell division ATP-binding protein FtsE  89.37 
 
 
219 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2543  cell division ATP-binding protein FtsE  88.89 
 
 
227 aa  358  5e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.772851  normal  0.715925 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0984  cell division ATP-binding protein FtsE  78.26 
 
 
236 aa  340  9e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1997  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  77.78 
 
 
219 aa  336  9.999999999999999e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1923  cell division ATP-binding protein FtsE  77.78 
 
 
219 aa  336  9.999999999999999e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0022  cell division ATP-binding protein FtsE  72.46 
 
 
235 aa  312  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.640793  normal  0.772345 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0100  cell division ATP-binding protein FtsE  69.08 
 
 
219 aa  310  7.999999999999999e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3091  cell division ATP-binding protein FtsE  76.33 
 
 
219 aa  305  4.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1176  cell division ABC transpoter ATP-binding protein  72.46 
 
 
219 aa  300  8.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.520301 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0943  ABC transporter related  71.5 
 
 
219 aa  296  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0834  ABC transporter related  71.5 
 
 
219 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.389037  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5218  cell division ATP-binding protein FtsE  70.05 
 
 
219 aa  292  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.649147  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0362  cell division ATP-binding protein FtsE  72.6 
 
 
220 aa  291  4e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2983  cell division ATP-binding protein FtsE  71.71 
 
 
237 aa  286  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2863  cell division ATP-binding protein FtsE  71.22 
 
 
253 aa  286  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3089  cell division ATP-binding protein FtsE  71.22 
 
 
237 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.29144  normal  0.611675 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2518  cell division ATP-binding protein FtsE  70.67 
 
 
220 aa  278  4e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2374  cell division ATP-binding protein FtsE  65.2 
 
 
285 aa  277  6e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.195215 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4867  ABC transporter related  70.53 
 
 
219 aa  277  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.459104  normal  0.762115 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0667  ABC transporter related  71.01 
 
 
219 aa  275  3e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0394716  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1154  cell division ATP-binding protein FtsE  69.57 
 
 
231 aa  275  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.386083  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2195  cell division ATP-binding protein FtsE  69.57 
 
 
232 aa  274  8e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.204033  normal  0.683604 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0576  ABC transporter, ATPase subunit  68.12 
 
 
219 aa  268  5e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2980  cell division ATP-binding protein FtsE  70.05 
 
 
230 aa  260  8.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135492  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1595  cell division ATP-binding protein FtsE  62.93 
 
 
219 aa  259  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.527082 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3217  cell division ATP-binding protein FtsE  60.4 
 
 
260 aa  253  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.11249  normal  0.222957 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3013  cell division ATP-binding protein FtsE  58.33 
 
 
235 aa  238  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563056  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2892  ABC transporter related  56.44 
 
 
237 aa  237  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.688447  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3254  ABC transporter component  57.77 
 
 
258 aa  225  4e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0701  ABC transporter related  57.14 
 
 
254 aa  223  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3498  ABC transporter related  52.79 
 
 
225 aa  211  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.552315 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3084  cell division ATP-binding protein FtsE  51.24 
 
 
223 aa  206  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.140031  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3056  ABC transporter related  51.37 
 
 
223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2017  ABC transporter related  51.22 
 
 
224 aa  192  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.661997  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1856  cell division ATP-binding protein FtsE  47.98 
 
 
223 aa  191  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.663349  normal  0.473161 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2451  ABC transporter related  49.52 
 
 
223 aa  191  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.16471  normal  0.153997 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1775  cell division ATP-binding protein FtsE  47.47 
 
 
226 aa  190  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.030617  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2412  cell division ATP-binding protein FtsE  47.52 
 
 
230 aa  190  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.122374  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1923  cell division ATP-binding protein FtsE  45.5 
 
 
229 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000106993  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1287  cell division ATP-binding protein FtsE  47.98 
 
 
223 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2996  Sigma 54 interacting domain protein  47.47 
 
 
223 aa  186  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000178962 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0733  cell division ATP-binding protein FtsE  49.04 
 
 
223 aa  185  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0478  ABC transporter related  51.72 
 
 
225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2387  ABC transporter related  48.08 
 
 
223 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.41405  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2478  cell division ATP-binding protein FtsE  45.45 
 
 
229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.831183  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3073  cell division ATP-binding protein FtsE  43.56 
 
 
228 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000242685  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1676  ATP-binding component of a membrane-associated cell division complex FtsE  48.99 
 
 
247 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0244  cell division ATP-binding protein FtsE  49.49 
 
 
249 aa  181  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3606  cell division ATP-binding protein FtsE  43.56 
 
 
227 aa  181  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107209  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0245  hypothetical protein  46.04 
 
 
227 aa  181  7e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0710  cell division ATP-binding protein FtsE  47.52 
 
 
227 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.387605  normal  0.298527 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2902  cell division ATP-binding protein FtsE  45.54 
 
 
222 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1932  cell division ATP-binding protein FtsE  49.49 
 
 
223 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2373  cell division ATP-binding protein FtsE  47.87 
 
 
233 aa  177  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000033444  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1761  cell division ATP-binding protein FtsE  46.03 
 
 
231 aa  176  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0793  cell division ATP-binding protein FtsE  45.64 
 
 
229 aa  176  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.475778  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2660  cell division ATP-binding protein FtsE  47.03 
 
 
224 aa  176  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8795  hitchhiker  0.0000942029 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002139  cell division transporter ATP-binding protein FtsE  47.34 
 
 
224 aa  176  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0306098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0428  cell division ATP-binding protein FtsE  45.45 
 
 
223 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4327  cell division ATP-binding protein FtsE  44.55 
 
 
223 aa  175  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4750  ABC transporter  45.45 
 
 
223 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199681  normal  0.0424479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5336  cell division ATP-binding protein FtsE  45.45 
 
 
223 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3723  cell division ATP-binding protein FtsE  45.41 
 
 
229 aa  176  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.402679  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0296  putative cell division ATP-binding protein FtsE  41.41 
 
 
228 aa  175  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000631483  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0291  cell division ATP-binding protein FtsE, putative  41.41 
 
 
228 aa  175  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000390691  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5160  cell division ATP-binding protein FtsE  45.45 
 
 
223 aa  175  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1453  cell-division ATP-binding protein  44.44 
 
 
229 aa  175  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687823  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4742  cell division ATP-binding protein FtsE  42.57 
 
 
228 aa  174  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1545  cell division ATP-binding protein FtsE  44.95 
 
 
222 aa  174  7e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3072  ABC transporter related  49.49 
 
 
229 aa  174  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.134895  hitchhiker  0.0099373 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0918  cell division ATP-binding protein FtsE  44.44 
 
 
226 aa  174  9e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.593583  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0471  cell division ATP-binding protein FtsE  46.53 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4587  cell division ATP-binding protein FtsE  43.43 
 
 
329 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387593  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0355  cell division ATP-binding protein FtsE  45.45 
 
 
223 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1046  cell division ATP-binding protein FtsE  42.42 
 
 
228 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0412114  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0982  cell division ATP-binding protein FtsE  44.44 
 
 
238 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.356751  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1582  cell division ATP-binding protein FtsE  47.47 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1611  cell division ATP-binding protein FtsE  47.47 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.701322  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00279  ABC transporter ATPase subunit  46.28 
 
 
235 aa  173  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1058  cell division ATP-binding protein FtsE  42.08 
 
 
230 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.219337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1636  cell division ATP-binding protein FtsE  47.47 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0480664  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0022  cell division ATP-binding protein FtsE  47.92 
 
 
238 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03312  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  45.05 
 
 
222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5110  cell division ATP-binding protein FtsE  44.95 
 
 
225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03265  hypothetical protein  45.05 
 
 
222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3781  cell division ATP-binding protein FtsE  46.97 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13119  cell division ATP-binding protein ftsE  47.47 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.762863 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3662  cell division protein FtsE  45.05 
 
 
222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0215  cell division ATP-binding protein  42.57 
 
 
217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.354221  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1606  cell division ATP-binding protein FtsE  42.42 
 
 
228 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4978  cell division ATP-binding protein FtsE  41.09 
 
 
228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2109  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  42.57 
 
 
217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4983  cell division ATP-binding protein FtsE  44.95 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4006  cell division ATP-binding protein FtsE  44.44 
 
 
246 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1996  cell division ATP-binding protein FtsE  44.95 
 
 
244 aa  172  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.736099  hitchhiker  0.00509364 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0253  cell division protein FtsE  45.05 
 
 
222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3839  cell division protein FtsE  44.55 
 
 
222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4783  cell division protein FtsE  44.55 
 
 
222 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>