15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0089 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007410  Ava_B0089  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  764    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0984829  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0092  hypothetical protein  83.78 
 
 
119 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0373001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3535  hypothetical protein  37.12 
 
 
252 aa  86.3  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3819  hypothetical protein  37.12 
 
 
252 aa  86.3  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3455  hypothetical protein  37.12 
 
 
252 aa  86.3  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3450  hypothetical protein  38.89 
 
 
254 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2245  hypothetical protein  38.6 
 
 
347 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000488792  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2249  hypothetical protein  36.63 
 
 
354 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000119994  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2616  hypothetical protein  29.85 
 
 
306 aa  70.9  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00545088 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2994  primosome, DnaD subunit  29.52 
 
 
430 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01527  hypothetical protein  30.66 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0517031  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01536  conserved hypothetical protein  30.66 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0921413  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1775  phage O family protein  29.2 
 
 
321 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2061  hypothetical protein  29.75 
 
 
304 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.927718  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0402  hypothetical protein  31.46 
 
 
384 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>