77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6361 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6361  cell divisionFtsK/SpoIIIE  100 
 
 
491 aa  961    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0921  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE-related protein  67.89 
 
 
483 aa  574  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5289  cell division protein FtsK/SpoIIIE  43.32 
 
 
476 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0696  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  42.83 
 
 
484 aa  300  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0152  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  43.72 
 
 
481 aa  293  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0042  cell divisionFtsK/SpoIIIE  43.82 
 
 
455 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4272  cell divisionFtsK/SpoIIIE  41.11 
 
 
530 aa  272  8.000000000000001e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000868926  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8557  cell divisionFtsK/SpoIIIE  41.51 
 
 
499 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  hitchhiker  0.00205824 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5523  cell divisionFtsK/SpoIIIE  41.3 
 
 
523 aa  261  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5993  cell divisionFtsK/SpoIIIE  39.56 
 
 
480 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000693624 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5592  cell division FtsK/SpoIIIE  39.56 
 
 
480 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1028  cell divisionFtsK/SpoIIIE  41.75 
 
 
519 aa  256  7e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.417448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5327  cell divisionFtsK/SpoIIIE  40.05 
 
 
523 aa  256  7e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0430668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6308  cell divisionFtsK/SpoIIIE  41.04 
 
 
519 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.835416  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3179  cell divisionFtsK/SpoIIIE  39.27 
 
 
481 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3167  cell divisionFtsK/SpoIIIE  39.27 
 
 
481 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.859597  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3229  cell divisionFtsK/SpoIIIE  39.27 
 
 
481 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0446654  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5540  cell divisionFtsK/SpoIIIE  40.93 
 
 
517 aa  249  9e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3034  cell divisionFtsK/SpoIIIE  41.14 
 
 
474 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0634  cell division FtsK/SpoIIIE  38.7 
 
 
460 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3398  cell divisionFtsK/SpoIIIE  41.25 
 
 
560 aa  201  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0000750555  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1288  cell divisionFtsK/SpoIIIE  34.93 
 
 
456 aa  199  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23840  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  33.56 
 
 
450 aa  184  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000868138  normal  0.396106 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1142  cell divisionFtsK/SpoIIIE  38.3 
 
 
409 aa  182  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1113  cell divisionFtsK/SpoIIIE  32.33 
 
 
460 aa  159  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1568  cell division FtsK/SpoIIIE  32.6 
 
 
433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.783737  hitchhiker  0.00309173 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0084  cell division FtsK/SpoIIIE  33.14 
 
 
460 aa  103  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8666  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  32.51 
 
 
450 aa  94.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0593  cell division protein FtsK/SpoIIIE  31.83 
 
 
446 aa  91.3  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000762932  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0138  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.74 
 
 
558 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.885055  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28960  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  33 
 
 
526 aa  76.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4530  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.88 
 
 
447 aa  68.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl100  DNA translocase (stage III sporulation protein E)  23.31 
 
 
953 aa  55.5  0.000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3333  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.12 
 
 
822 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0786  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.47 
 
 
830 aa  53.1  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0101179  normal  0.147474 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0587  FtsK/SpoIIIE family protein  27.44 
 
 
607 aa  52.4  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.58399 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4588  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.57 
 
 
1812 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4147  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.47 
 
 
1502 aa  51.2  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0632  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.04 
 
 
1679 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0843  FtsK/SpoIIIE family protein  24.55 
 
 
797 aa  50.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5334  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.14 
 
 
1736 aa  50.8  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0405049  normal  0.265694 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1336  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25 
 
 
788 aa  50.4  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599515  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1362  cell division protein FtsK/SpoIIIE  25 
 
 
788 aa  50.4  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.174513  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0175  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE-related protein  29.14 
 
 
1807 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.78855  hitchhiker  0.000743422 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1184  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE-related protein  29.14 
 
 
1807 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274643  normal  0.284546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8141  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.05 
 
 
1463 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0439  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.49 
 
 
763 aa  48.5  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0859833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0083  cell division protein FtsK/SpoIIIE  25.08 
 
 
833 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1419  FHA domain containing protein  33.33 
 
 
1468 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.49197  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1302  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  26.53 
 
 
1528 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1153  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.34 
 
 
1229 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.718095  normal  0.251355 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1143  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.34 
 
 
1229 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.727528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1126  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.34 
 
 
1229 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2606  cell divisionFtsK/SpoIIIE  33.19 
 
 
1438 aa  47.4  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2124  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.45 
 
 
1579 aa  47  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.15343  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2695  FHA domain-containing protein  28.84 
 
 
1363 aa  47.4  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0650  putative cell division protein FtsK  24.21 
 
 
809 aa  47  0.0008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1871  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.66 
 
 
655 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2581  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.14 
 
 
2947 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3724  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.78 
 
 
366 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0821  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE  28.28 
 
 
924 aa  45.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3123  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.57 
 
 
1446 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341793  decreased coverage  0.000461331 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21520  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  29.27 
 
 
1488 aa  45.4  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2426  FHA domain containing protein  26.37 
 
 
1346 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0389758 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1164  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.63 
 
 
907 aa  44.3  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.804507  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1038  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.56 
 
 
739 aa  44.3  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.987918  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0797  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.77 
 
 
669 aa  44.3  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1741  FHA domain-containing protein  27.83 
 
 
1484 aa  44.3  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.082515  normal  0.707521 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2586  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.06 
 
 
716 aa  44.3  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0701867  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4516  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.67 
 
 
1136 aa  44.3  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.169097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1334  FHA domain containing protein  30.34 
 
 
1488 aa  43.9  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0336  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.57 
 
 
801 aa  43.9  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4034  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.33 
 
 
1134 aa  43.5  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0643851 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3940  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.7 
 
 
842 aa  43.5  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4404  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.33 
 
 
1091 aa  43.5  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.508472 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0416  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.4 
 
 
816 aa  43.5  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.538525  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06250  putative FtsK/SpoIIIE-like protein  27.27 
 
 
798 aa  43.5  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.996423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>