82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1288 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1288  cell divisionFtsK/SpoIIIE  100 
 
 
456 aa  917    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23840  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  48.56 
 
 
450 aa  374  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.0000868138  normal  0.396106 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1568  cell division FtsK/SpoIIIE  49.64 
 
 
433 aa  358  1.9999999999999998e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.783737  hitchhiker  0.00309173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1113  cell divisionFtsK/SpoIIIE  43.99 
 
 
460 aa  320  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8557  cell divisionFtsK/SpoIIIE  37.98 
 
 
499 aa  219  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  hitchhiker  0.00205824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0042  cell divisionFtsK/SpoIIIE  38.34 
 
 
455 aa  206  8e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6308  cell divisionFtsK/SpoIIIE  36.76 
 
 
519 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.835416  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4272  cell divisionFtsK/SpoIIIE  35.51 
 
 
530 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000868926  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1028  cell divisionFtsK/SpoIIIE  36.45 
 
 
519 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.417448 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5540  cell divisionFtsK/SpoIIIE  36.45 
 
 
517 aa  197  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5289  cell division protein FtsK/SpoIIIE  34.18 
 
 
476 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6361  cell divisionFtsK/SpoIIIE  35.1 
 
 
491 aa  193  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3229  cell divisionFtsK/SpoIIIE  33.18 
 
 
481 aa  192  8e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0446654  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3179  cell divisionFtsK/SpoIIIE  33.18 
 
 
481 aa  192  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3167  cell divisionFtsK/SpoIIIE  33.18 
 
 
481 aa  192  8e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.859597  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5993  cell divisionFtsK/SpoIIIE  34.02 
 
 
480 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000693624 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5592  cell division FtsK/SpoIIIE  34.02 
 
 
480 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0696  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  34.33 
 
 
484 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0152  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  37.89 
 
 
481 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5327  cell divisionFtsK/SpoIIIE  35.52 
 
 
523 aa  186  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0430668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5523  cell divisionFtsK/SpoIIIE  36.01 
 
 
523 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0921  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE-related protein  35.31 
 
 
483 aa  179  9e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3034  cell divisionFtsK/SpoIIIE  34.62 
 
 
474 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3398  cell divisionFtsK/SpoIIIE  37.76 
 
 
560 aa  161  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.0000750555  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0634  cell division FtsK/SpoIIIE  33.8 
 
 
460 aa  157  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1142  cell divisionFtsK/SpoIIIE  32.49 
 
 
409 aa  137  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28960  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  29.37 
 
 
526 aa  75.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0138  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.93 
 
 
558 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.885055  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0593  cell division protein FtsK/SpoIIIE  25.47 
 
 
446 aa  68.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000762932  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4530  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.92 
 
 
447 aa  63.9  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8666  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  27.44 
 
 
450 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08760  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.98 
 
 
758 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00860549  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0416  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.42 
 
 
816 aa  53.9  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.538525  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0439  FtsK/SpoIIIE family protein  27.42 
 
 
814 aa  53.9  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.549102  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl100  DNA translocase (stage III sporulation protein E)  24.44 
 
 
953 aa  53.5  0.000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0006  cell divisionFtsK/SpoIIIE  31.19 
 
 
501 aa  53.5  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168458  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_381  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE, S-DNA-T family  27.42 
 
 
814 aa  53.9  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0786  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.29 
 
 
830 aa  52.4  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0101179  normal  0.147474 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0084  cell division FtsK/SpoIIIE  25.53 
 
 
460 aa  51.6  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1265  DNA translocase FtsK  26.72 
 
 
740 aa  49.3  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1362  cell division protein FtsK/SpoIIIE  24.54 
 
 
788 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.174513  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1336  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.54 
 
 
788 aa  48.9  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599515  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4268  FHA domain containing protein  28.65 
 
 
1399 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1463  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.2 
 
 
809 aa  49.3  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1072  cell division FtsK/SpoIIIE  25.5 
 
 
774 aa  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.272845 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2445  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25 
 
 
793 aa  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000220657  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0797  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.49 
 
 
669 aa  47.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4199  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.04 
 
 
894 aa  47.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0219443 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1154  DNA segregation ATPase FtsK  24.57 
 
 
787 aa  47.8  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.66945  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1741  FHA domain-containing protein  26.76 
 
 
1484 aa  47.4  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.082515  normal  0.707521 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1420  cell division FtsK/SpoIIIE  24.66 
 
 
776 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.538178  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3930  stage III sporulation protein E  24.14 
 
 
793 aa  47.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000252394  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3828  stage III sporulation protein E  24.14 
 
 
793 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000134118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3645  stage III sporulation protein E  24.14 
 
 
793 aa  47.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00104928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3535  stage III sporulation protein E (DNA translocase SpoIIIE)  24.14 
 
 
793 aa  47.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000424384  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3806  stage III sporulation protein E  24.22 
 
 
793 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98433e-27 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1406  DNA translocase FtsK  24.22 
 
 
793 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000239952  hitchhiker  0.000000381698 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3893  stage III sporulation protein E  24.22 
 
 
793 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0045654  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3842  stage III sporulation protein E  24.14 
 
 
793 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000180384  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3553  stage III sporulation protein E (DNA translocase SpoIIIE)  24.14 
 
 
793 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0180152  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0632  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.83 
 
 
1679 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0175  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE-related protein  28.11 
 
 
1807 aa  46.2  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.78855  hitchhiker  0.000743422 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1184  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE-related protein  28.11 
 
 
1807 aa  46.2  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274643  normal  0.284546 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2581  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.64 
 
 
2947 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4588  cell divisionFtsK/SpoIIIE  26.72 
 
 
1812 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0009  FtsK/SpoIIIE family protein  25.41 
 
 
280 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3724  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.93 
 
 
366 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1955  FtsK/SpoIIIE family protein  25.74 
 
 
788 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0484532  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3351  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.31 
 
 
1035 aa  44.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4520  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.3 
 
 
1393 aa  45.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398997  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1465  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.74 
 
 
822 aa  45.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1151  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.47 
 
 
646 aa  45.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1381  cell division protein  25.9 
 
 
804 aa  44.3  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0843  FtsK/SpoIIIE family protein  23.51 
 
 
797 aa  44.7  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4990  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.72 
 
 
963 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.162122  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2066  cell divisionFtsK/SpoIIIE  24.61 
 
 
776 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0763  DNA segregation ATPase  25.54 
 
 
608 aa  43.9  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0457754  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0195  cell division FtsK/SpoIIIE  26.09 
 
 
1199 aa  43.5  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0835141  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0837  cell divisionFtsK/SpoIIIE  25.94 
 
 
727 aa  43.5  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0587  FtsK/SpoIIIE family protein  24.74 
 
 
607 aa  43.5  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.58399 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5659  cell divisionFtsK/SpoIIIE  23.12 
 
 
388 aa  43.5  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.255861  normal  0.0102641 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1529  FtsK/SpoIIIE family protein  25.3 
 
 
816 aa  43.1  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0393755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>