14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0918 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0918  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  297  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1140  hypothetical protein  41.13 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.180925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1026  hypothetical protein  42.55 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.533429 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6359  hypothetical protein  37.31 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6310  plasmid replication, integration and excision activator  41.84 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.370605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5541  plasmid replication, integration and excision activator  41.13 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4271  hypothetical protein  36.81 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000446812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0153  hypothetical protein  33.87 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5329  hypothetical protein  37.06 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0343957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0698  hypothetical protein  34.45 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.353371 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8555  hypothetical protein  34.06 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149601  hitchhiker  0.000517755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5525  hypothetical protein  36.88 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0045  hypothetical protein  32.35 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5287  hypothetical protein  32.84 
 
 		 136 aa  43.5  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>