25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0086 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0086  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  486  1e-136  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01020  hypothetical protein  54.88 
 
 
265 aa  246  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.551056  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5416  hypothetical protein  44.98 
 
 
273 aa  184  2e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.720653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5035  hypothetical protein  45.34 
 
 
273 aa  182  4e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478357  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5123  hypothetical protein  45.34 
 
 
273 aa  182  4e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5663  hypothetical protein  42.97 
 
 
266 aa  172  6e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.570228  normal  0.031893 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1144  hypothetical protein  42.11 
 
 
262 aa  165  6e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0437754  normal  0.0600359 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0174  hypothetical protein  46.04 
 
 
263 aa  153  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5476  hypothetical protein  41.13 
 
 
254 aa  145  7e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13873  hypothetical protein  38.8 
 
 
258 aa  145  7e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0142  hypothetical protein  38.52 
 
 
245 aa  134  1e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2657  hypothetical protein  38.84 
 
 
244 aa  121  1e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00775221  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0175  hypothetical protein  30.93 
 
 
250 aa  83.2  4e-15  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0933557  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1109  hypothetical protein  31.14 
 
 
327 aa  72.8  4e-12  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182239  normal  0.383462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4368  hypothetical protein  30.77 
 
 
239 aa  68.9  7e-11  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3402  hypothetical protein  29.27 
 
 
242 aa  57.4  2e-07  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0197129  normal  0.301913 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4935  hypothetical protein  30.64 
 
 
245 aa  56.6  4e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4817  hypothetical protein  30.04 
 
 
239 aa  55.5  9e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3405  hypothetical protein  29.11 
 
 
247 aa  50.8  2e-05  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214353  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4816  hypothetical protein  26.95 
 
 
304 aa  46.6  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.536398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5122  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  31.33 
 
 
266 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5502  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31.33 
 
 
266 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5211  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31.33 
 
 
266 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.733021  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5737  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  30.11 
 
 
270 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.602445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1085  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31.11 
 
 
276 aa  42.4  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.429706  normal  0.50341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>