19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0039 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0039  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  254  4e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.855389  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2136  hypothetical protein  37.5 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.926167  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4193  hypothetical protein  35.51 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7316  hypothetical protein  37.84 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.152418 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39330  hypothetical protein  33.64 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.680762 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4561  hypothetical protein  33.64 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.453819  normal  0.811207 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5380  hypothetical protein  32.79 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5079  hypothetical protein  33.64 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.498009  hitchhiker  0.0000432402 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7033  hypothetical protein  33.94 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4746  hypothetical protein  37.27 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5749  hypothetical protein  33.64 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5462  hypothetical protein  33.64 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0140337 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5373  hypothetical protein  33.64 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0559752  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4527  hypothetical protein  37.84 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6037  hypothetical protein  33.64 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10048  hypothetical protein  32.73 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.329564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0870  hypothetical protein  32.73 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.533265 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5072  hypothetical protein  32.69 
 
 		 132 aa  51.2  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.547108  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5919  hypothetical protein  33.02 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>