23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3772 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3772  protein of unknown function DUF456  100 
 
 
167 aa  307  5e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3993  hypothetical protein  78.92 
 
 
166 aa  248  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27270  Protein of unknown function (DUF456)  44.08 
 
 
170 aa  115  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.236002  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19890  hypothetical protein  50.76 
 
 
165 aa  106  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.649353  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4044  protein of unknown function DUF456  37.91 
 
 
159 aa  86.7  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16000  Protein of unknown function (DUF456)  38.71 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.148783  normal  0.0914905 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0664  hypothetical protein  32.68 
 
 
157 aa  77  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0288472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2960  hypothetical protein  41.94 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.51807  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0722  hypothetical protein  37.25 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1686  protein of unknown function DUF456  33.56 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0492481  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0095  hypothetical protein  28.87 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0104  hypothetical protein  28.87 
 
 
160 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.199717 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1532  hypothetical protein  35.66 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0624636  hitchhiker  0.00770701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1497  hypothetical protein  30.95 
 
 
220 aa  63.9  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0085  hypothetical protein  28.87 
 
 
160 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.296406 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0112  hypothetical protein  35.26 
 
 
161 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0737  hypothetical protein  32.87 
 
 
161 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2540  protein of unknown function DUF456  38.02 
 
 
164 aa  52  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.658317  normal  0.52211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4908  hypothetical protein  36.67 
 
 
161 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.417496  decreased coverage  0.00174056 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28240  hypothetical protein  44.32 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04813  hypothetical protein  30.53 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1793  hypothetical protein  30.07 
 
 
162 aa  42.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1263  protein of unknown function DUF456  29.93 
 
 
172 aa  42.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>