17 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Rpic12D_0207  CDS  NC_012856  218003  220915  -  2913  UvrD/REP helicase  YP_002980188  unclonable  0.00182272  decreased coverage  0.0000000525372  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_2282  CDS  NC_012856  2413568  2413807  -  240  transcriptional regulator, XRE family  YP_002982228  hitchhiker  0.000103293  unclonable  0.0000000000302962  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_2283  CDS  NC_012856  2413882  2414760  +  879  putative phage repressor  YP_002982229  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_2284  CDS  NC_012856  2415360  2415671  +  312  hypothetical protein  YP_002982230  hitchhiker  0.00647318  unclonable  0.0000000000443578  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_2285  CDS  NC_012856  2415675  2415836  +  162  hypothetical protein  YP_002982231  hitchhiker  0.00141927  unclonable  0.0000000000397085  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_2286  CDS  NC_012856  2415849  2416205  +  357  hypothetical protein  YP_002982232  hitchhiker  0.000194351  unclonable  0.0000000000466406  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_2287  CDS  NC_012856  2416212  2416373  +  162  hypothetical protein  YP_002982233  hitchhiker  0.0004525  unclonable  0.0000000000471179  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_2288  CDS  NC_012856  2416399  2417232  +  834  pentapeptide repeat protein  YP_002982234  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_2289  CDS  NC_012856  2417262  2417459  +  198  hypothetical protein  YP_002982235  normal  0.0241353  unclonable  0.0000000000439085  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_2290  CDS  NC_012856  2417478  2417624  +  147  hypothetical protein  YP_002982236  normal  0.0203537  unclonable  0.000000000041344  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_2291  CDS  NC_012856  2417628  2417786  +  159  hypothetical protein  YP_002982237  normal  0.0448463  unclonable  0.0000000000409251  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_2292  CDS  NC_012856  2417786  2417977  +  192  hypothetical protein  YP_002982238  normal  0.0547559  unclonable  0.0000000000393062  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_2293  CDS  NC_012856  2417994  2418257  +  264  hypothetical protein  YP_002982239  normal  0.0567352  unclonable  0.0000000000381377  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_2939  CDS  NC_012856  3090650  3090958  -  309  50S ribosomal protein L24  YP_002982881  unclonable  0.000000068942  hitchhiker  0.00000399132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_2950  CDS  NC_012856  3095714  3096367  -  654  50S ribosomal protein L3  YP_002982892  unclonable  0.000000276942  decreased coverage  0.000000134206  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4021  CDS  NC_012857  596836  597645  +  810  alpha/beta hydrolase fold protein  YP_002983943  unclonable  0.000000197083  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Rpic12D_4022  CDS  NC_012857  597785  598288  -  504  thioesterase superfamily protein  YP_002983944  unclonable  0.0000000809189  normal  1  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>