12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Ser-1 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  tRNA-Ser-1  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0536028  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0041  tRNA-Ser  95 
 
 		 91 bp  63.9  0.000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1096  tRNA-Ser  95 
 
 		 91 bp  63.9  0.000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0058  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 91 bp  50.1  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.645587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60450  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.287736  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t68  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.613461  normal  0.197969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52560  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00373165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0041  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0195063  normal  0.685776 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0075  tRNA-Ser  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781608  hitchhiker  0.00063206 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4609  tRNA-Ser  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0082  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0063  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0394171  normal  0.40754 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>