14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_A0027 on replicon NC_009704
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009704  YpsIP31758_A0027  conjugal transfer relaxosome component TraJ  100 
 
 		 118 aa  236  6.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.88401e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2648  hypothetical protein  48.62 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.382598  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4314  conjugal transfer relaxosome component TraJ  50.89 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2539  conjugal transfer relaxosome component TraJ  50.89 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0128505  hitchhiker  0.0000206935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15510  conjugal transfer relaxosome component TraJ  49.11 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  1.15987e-16  unclonable  4.24515e-22 
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4672  conjugal transfer relaxosome component TraJ  39.32 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6527  conjugal transfer relaxosome component TraJ  50 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457965  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6610  conjugal transfer relaxosome component TraJ  50 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2250  conjugal transfer relaxosome component TraJ  48.25 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0350  helix-turn-helix protein, CopG  41.56 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0302097  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0372  traJ protein  42.67 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.498528  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0765  putative plasmid conjugal transfer protein  42.22 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0269  putative plasmid conjugal transfer protein  29.58 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1092  mobilization protein MobB  38.67 
 
 		 104 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.12734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>