12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2539 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2539  conjugal transfer relaxosome component TraJ  100 
 
 		 123 aa  250  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0128505  hitchhiker  0.0000206935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15510  conjugal transfer relaxosome component TraJ  94.26 
 
 		 123 aa  199  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  1.15987e-16  unclonable  4.24515e-22 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4314  conjugal transfer relaxosome component TraJ  82.93 
 
 		 123 aa  169  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6527  conjugal transfer relaxosome component TraJ  77.05 
 
 		 124 aa  155  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457965  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6610  conjugal transfer relaxosome component TraJ  77.05 
 
 		 124 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4672  conjugal transfer relaxosome component TraJ  60.34 
 
 		 124 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2250  conjugal transfer relaxosome component TraJ  59.65 
 
 		 117 aa  107  8.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2648  hypothetical protein  55.45 
 
 		 214 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.382598  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0027  conjugal transfer relaxosome component TraJ  50.89 
 
 		 118 aa  80.1  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.88401e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0372  traJ protein  38.39 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.498528  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0350  helix-turn-helix protein, CopG  33.33 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0302097  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0269  putative plasmid conjugal transfer protein  35.21 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>