10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3689 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3689  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  628  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4056  hypothetical protein  53.74 
 
 		 313 aa  301  1e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0397  hypothetical protein  51.6 
 
 		 307 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.567946  normal  0.20063 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4121  hypothetical protein  53.62 
 
 		 307 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.442836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0015  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.838494  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0011  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0020  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00212726  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0041  hypothetical protein  32.25 
 
 		 308 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.432272  normal  0.0746912 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0048  hypothetical protein  34 
 
 		 300 aa  152  8e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000955656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3369  IS21 family transposition helper protein  46.61 
 
 		 275 aa  117  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>