21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2708 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2623  putative lipoprotein  100 
 
 		 191 aa  394  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1585  putative lipoprotein  100 
 
 		 191 aa  394  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2708  putative lipoprotein  100 
 
 		 191 aa  394  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1657  putative lipoprotein  57.51 
 
 		 182 aa  213  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1046  putative lipoprotein  47.92 
 
 		 171 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0929  putative lipoprotein  47.4 
 
 		 171 aa  161  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.621879  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1027  putative lipoprotein  47.4 
 
 		 171 aa  161  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0964  putative lipoprotein  47.4 
 
 		 171 aa  161  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0996  putative lipoprotein  47.4 
 
 		 171 aa  160  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.629941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1381  putative lipoprotein  46.35 
 
 		 172 aa  160  9e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.135623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00876  hypothetical protein  45.83 
 
 		 171 aa  153  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272804  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00870  predicted lipoprotein  45.83 
 
 		 171 aa  153  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.284686  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2731  putative lipoprotein  45.83 
 
 		 171 aa  153  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.658274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0969  putative lipoprotein  45.83 
 
 		 171 aa  153  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2777  putative lipoprotein  45.83 
 
 		 171 aa  153  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0075332  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0938  putative lipoprotein  45.31 
 
 		 171 aa  153  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.200868  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0893  putative lipoprotein  45.83 
 
 		 171 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1025  putative lipoprotein  45.31 
 
 		 171 aa  151  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2466  putative lipoprotein  44.79 
 
 		 171 aa  150  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.835253  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2239  hypothetical protein  26.92 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1724  hypothetical protein  29.06 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000194872 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>