20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0893 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



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Replicon accession

Locus tag

Product

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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0893  putative lipoprotein  100 
 
 
171 aa  352  1e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1025  putative lipoprotein  98.25 
 
 
171 aa  346  8e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2731  putative lipoprotein  91.23 
 
 
171 aa  328  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.658274  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00876  hypothetical protein  91.23 
 
 
171 aa  328  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272804  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00870  predicted lipoprotein  91.23 
 
 
171 aa  328  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.284686  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0969  putative lipoprotein  91.23 
 
 
171 aa  328  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2777  putative lipoprotein  91.23 
 
 
171 aa  328  2e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0075332  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0938  putative lipoprotein  89.47 
 
 
171 aa  321  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.200868  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2466  putative lipoprotein  88.89 
 
 
171 aa  319  9.999999999999999e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.835253  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0964  putative lipoprotein  84.8 
 
 
171 aa  302  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1027  putative lipoprotein  84.8 
 
 
171 aa  302  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0929  putative lipoprotein  84.8 
 
 
171 aa  302  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.621879  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1046  putative lipoprotein  84.8 
 
 
171 aa  302  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0996  putative lipoprotein  84.21 
 
 
171 aa  299  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.629941  normal 
 
 
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NC_009436  Ent638_1381  putative lipoprotein  81.98 
 
 
172 aa  287  5.0000000000000004e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.135623  normal 
 
 
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NC_009832  Spro_1657  putative lipoprotein  51.91 
 
 
182 aa  181  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.541556 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1585  putative lipoprotein  45.61 
 
 
191 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010465  YPK_2708  putative lipoprotein  45.61 
 
 
191 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009708  YpsIP31758_2623  putative lipoprotein  45.61 
 
 
191 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_2239  hypothetical protein  24.69 
 
 
181 aa  41.6  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.60087  normal 
 
 
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