24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2659 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_2659  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  612  9.999999999999999e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.73964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1966  hypothetical protein  99.33 
 
 
297 aa  607  1e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.778815 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2570  hypothetical protein  99.66 
 
 
297 aa  610  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1774  hypothetical protein  73.06 
 
 
297 aa  471  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2046  hypothetical protein  73.65 
 
 
297 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1720  hypothetical protein  71.96 
 
 
298 aa  469  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2304  hypothetical protein  74.16 
 
 
298 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.537216  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2203  hypothetical protein  73.15 
 
 
298 aa  441  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0995  hypothetical protein  54.73 
 
 
297 aa  345  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1022  hypothetical protein  54.73 
 
 
297 aa  343  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.521569  normal  0.540479 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1087  hypothetical protein  54.73 
 
 
297 aa  343  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.453979  normal  0.317338 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1054  hypothetical protein  54.73 
 
 
297 aa  343  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.867666  normal  0.109252 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1438  hypothetical protein  54.73 
 
 
297 aa  343  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1103  hypothetical protein  54.39 
 
 
297 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.121194  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2724  conserved hypothetical protein  53.72 
 
 
297 aa  340  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00414724  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00930  hypothetical protein  53.72 
 
 
297 aa  340  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0759477  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1081  hypothetical protein  53.72 
 
 
297 aa  340  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00879284  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2404  hypothetical protein  53.72 
 
 
297 aa  340  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000313233  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2200  hypothetical protein  53.72 
 
 
297 aa  340  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00642292  normal  0.156122 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2677  hypothetical protein  53.72 
 
 
297 aa  340  2e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0690394  normal  0.288548 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1018  hypothetical protein  53.72 
 
 
297 aa  340  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000257465  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1026  hypothetical protein  53.72 
 
 
297 aa  340  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0069797  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00923  hypothetical protein  53.72 
 
 
297 aa  340  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0808004  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4461  aminoglycoside phosphotransferase  24.5 
 
 
298 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>