25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1809 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1699  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  373  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2636  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  373  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1809  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  373  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0898906  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2127  putative yfeABCD locus regulator  75 
 
 		 186 aa  287  6e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.698099  normal  0.0100238 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2021  hypothetical protein  67.4 
 
 		 178 aa  261  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1848  hypothetical protein  67.4 
 
 		 178 aa  261  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000354455  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1437  hypothetical protein  67.4 
 
 		 178 aa  261  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1452  hypothetical protein  67.4 
 
 		 178 aa  261  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.414279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1420  hypothetical protein  67.4 
 
 		 178 aa  261  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.372841  hitchhiker  0.00228565 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1914  hypothetical protein  62.78 
 
 		 182 aa  259  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0107711  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2206  hypothetical protein  62.22 
 
 		 182 aa  258  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0544511  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1718  putative regulatory protein  64.64 
 
 		 178 aa  253  8e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.631087  normal  0.835188 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2029  hypothetical protein  59.67 
 
 		 182 aa  250  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1916  conserved hypothetical protein  64.25 
 
 		 178 aa  247  7e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1971  hypothetical protein  64.25 
 
 		 178 aa  247  9e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01683  hypothetical protein  64.25 
 
 		 178 aa  247  9e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.743712  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01695  predicted inner membrane protein  64.25 
 
 		 178 aa  247  9e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.881949  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1906  hypothetical protein  64.25 
 
 		 178 aa  247  9e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.23901  normal  0.712984 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1946  hypothetical protein  64.25 
 
 		 178 aa  247  9e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.454833  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1807  hypothetical protein  64.25 
 
 		 178 aa  247  9e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.296326  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1465  hypothetical protein  64.25 
 
 		 178 aa  246  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1974  hypothetical protein  60.22 
 
 		 182 aa  246  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2444  hypothetical protein  63.69 
 
 		 178 aa  245  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3281  putative yfeABCD locus regulator  33.89 
 
 		 180 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.653865  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0088  putative yfeABCD locus regulator  31.67 
 
 		 181 aa  104  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>