25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2206 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2206  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  366  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0544511  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1914  hypothetical protein  93.96 
 
 
182 aa  351  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0107711  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2029  hypothetical protein  70.56 
 
 
182 aa  275  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1974  hypothetical protein  64.44 
 
 
182 aa  261  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.170077  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1699  hypothetical protein  62.22 
 
 
184 aa  258  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2636  hypothetical protein  62.22 
 
 
184 aa  258  3e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1809  hypothetical protein  62.22 
 
 
184 aa  258  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0898906  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2127  putative yfeABCD locus regulator  65 
 
 
186 aa  255  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.698099  normal  0.0100238 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2021  hypothetical protein  63.13 
 
 
178 aa  251  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1848  hypothetical protein  63.13 
 
 
178 aa  251  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000354455  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1437  hypothetical protein  63.13 
 
 
178 aa  251  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1452  hypothetical protein  63.13 
 
 
178 aa  251  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.414279  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1420  hypothetical protein  63.13 
 
 
178 aa  251  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.372841  hitchhiker  0.00228565 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1916  conserved hypothetical protein  62.01 
 
 
178 aa  243  9e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1971  hypothetical protein  61.45 
 
 
178 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01683  hypothetical protein  61.45 
 
 
178 aa  242  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.743712  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01695  predicted inner membrane protein  61.45 
 
 
178 aa  242  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.881949  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1465  hypothetical protein  61.45 
 
 
178 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1906  hypothetical protein  61.45 
 
 
178 aa  242  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.23901  normal  0.712984 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1946  hypothetical protein  61.45 
 
 
178 aa  242  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.454833  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1807  hypothetical protein  61.45 
 
 
178 aa  242  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.296326  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2444  hypothetical protein  60.89 
 
 
178 aa  241  6e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1718  putative regulatory protein  60.34 
 
 
178 aa  239  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.631087  normal  0.835188 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3281  putative yfeABCD locus regulator  29.44 
 
 
180 aa  105  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.653865  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0088  putative yfeABCD locus regulator  30.86 
 
 
181 aa  84.3  9e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>