63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5555 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012792  Vapar_5555  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
130 aa  270  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4070  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.71 
 
 
145 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.239631  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0640  hypothetical protein  72.6 
 
 
73 aa  114  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2245  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.74 
 
 
131 aa  109  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0703101 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3023  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.8 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0559181  normal  0.869629 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3749  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.17 
 
 
214 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.127226  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1430  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.75 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.363294  normal  0.672766 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1457  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.17 
 
 
142 aa  57  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2014  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
135 aa  54.3  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2347  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.36 
 
 
125 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.197691  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2005  hypothetical protein  32.46 
 
 
267 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054169  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2712  hypothetical protein  44.68 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392579  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.5 
 
 
126 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03509  bleomycin resistance protein  32.46 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0882  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.67 
 
 
123 aa  47.8  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0333259 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1026  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.67 
 
 
123 aa  47.8  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742854  normal  0.054762 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2150  putative bleomycin resistance protein  31.36 
 
 
124 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.717419  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1008  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.46 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.303728  normal  0.778304 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23670  hypothetical protein  31.58 
 
 
267 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0174073 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3584  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.72 
 
 
192 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.971412  normal  0.452058 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0028  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.41 
 
 
127 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.402975 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0624  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.24 
 
 
139 aa  46.6  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.270433  normal  0.0374079 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.82 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.915388 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0978  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.23 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00125904  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1848  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.62 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.538591  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4131  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.66 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.385176  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3290  hypothetical protein  30.51 
 
 
139 aa  44.3  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02481  hypothetical protein  30.89 
 
 
155 aa  43.9  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.38 
 
 
119 aa  43.9  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.94151 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2460  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.19 
 
 
138 aa  43.5  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2842  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.74 
 
 
143 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10557  hypothetical protein  26.85 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.309454  normal  0.0411848 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0529  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.215842  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3654  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.7 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178047  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0381  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.1 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0071702  normal  0.210559 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0109  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.77 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2424  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.4 
 
 
136 aa  41.6  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0566516  hitchhiker  0.00174079 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4569  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.77 
 
 
124 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2789  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.51 
 
 
136 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4319  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.24 
 
 
126 aa  41.6  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.386422  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0820  hypothetical protein  31.25 
 
 
116 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.297026 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2493  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.83 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000450738  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2580  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.25 
 
 
147 aa  41.2  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0814161  normal  0.0105552 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2795  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.18 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111231  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2280  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.1 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.494314  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2889  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.51 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6483  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.47 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1285  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.93 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.78652  hitchhiker  0.00110448 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4570  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.23 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.623689  normal  0.46324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1329  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.03 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2692  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.33 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0659876  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4303  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38 
 
 
132 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.477386 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3856  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.207076  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1309  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.1 
 
 
155 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0637718  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0556  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.58 
 
 
151 aa  40.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3490  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.3 
 
 
439 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408321  normal  0.559549 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0631  hypothetical protein  38 
 
 
132 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.320962  normal  0.0102105 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3041  putative lyase  30.16 
 
 
138 aa  40  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467192  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5978  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.67 
 
 
124 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.840532  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0561  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.2 
 
 
154 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0280356  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4899  metallothiol transferase FosB  27.05 
 
 
140 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3869  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.43 
 
 
439 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.527726  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0564  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.64 
 
 
138 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000336397  normal  0.204677 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>