25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3978 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3978  protein of unknown function DUF1161  100 
 
 		 110 aa  220  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.234117  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3604  hypothetical protein  52.94 
 
 		 122 aa  99.4  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.476197  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0041  hypothetical protein  45.83 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00480  hypothetical protein  44.44 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.659368 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0038  hypothetical protein  42.47 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0151  hypothetical protein  42.11 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01140  hypothetical protein  47.95 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.147153  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0154  hypothetical protein  41.1 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0041  hypothetical protein  41.1 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0105  hypothetical protein  53.7 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000414235 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00720  hypothetical protein  43.28 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0099  hypothetical protein  42.47 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0060  hypothetical protein  43.28 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0105  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0090  hypothetical protein  48.15 
 
 		 98 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420006 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4456  hypothetical protein  45.83 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2124  hypothetical protein  38.46 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0087  hypothetical protein  42.86 
 
 		 87 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0108  hypothetical protein  48.08 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72225  hitchhiker  0.00358532 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0105  hypothetical protein  41.1 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00162426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0102  hypothetical protein  40 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0102  hypothetical protein  40 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000505882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0096  hypothetical protein  37.88 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1866  putative lipoprotein  37.66 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.380587  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1978  hypothetical protein  37.66 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>