27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2124 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2124  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  280  5.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01140  hypothetical protein  40 
 
 
99 aa  57.4  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.147153  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0151  hypothetical protein  33.66 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4456  hypothetical protein  41.67 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0108  hypothetical protein  36.36 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72225  hitchhiker  0.00358532 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0105  hypothetical protein  37.1 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0090  hypothetical protein  37.1 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420006 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0105  hypothetical protein  41.94 
 
 
73 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0041  hypothetical protein  38.71 
 
 
75 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.116069  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0105  hypothetical protein  36.36 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000414235 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0102  hypothetical protein  38.71 
 
 
73 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0102  hypothetical protein  38.71 
 
 
73 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000505882 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00480  hypothetical protein  37.1 
 
 
75 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.659368 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0041  hypothetical protein  38.57 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0087  hypothetical protein  37.1 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0154  hypothetical protein  30.43 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2047  hypothetical protein  33.67 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.58796  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2348  protein of unknown function DUF1161  34.18 
 
 
99 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0734587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3978  protein of unknown function DUF1161  38.46 
 
 
110 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.234117  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0096  hypothetical protein  30.16 
 
 
79 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3604  hypothetical protein  36.11 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.476197  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00720  hypothetical protein  38.71 
 
 
77 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0099  hypothetical protein  33.87 
 
 
74 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0038  hypothetical protein  30.65 
 
 
74 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1866  putative lipoprotein  36.51 
 
 
81 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.380587  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1978  hypothetical protein  36.51 
 
 
81 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0060  hypothetical protein  38.71 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>