30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0727 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E2400  cell division protein MukB  58.38 
 
 
1486 aa  1732    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003934  chromosome partition protein MukB  73.66 
 
 
1489 aa  2221    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2051  cell division protein MukB  59.42 
 
 
1479 aa  1722    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0962316  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1779  cell division protein MukB  59.47 
 
 
1479 aa  1721    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2299  cell division protein MukB  60.07 
 
 
1478 aa  1759    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00935  hypothetical protein  58.59 
 
 
1486 aa  1738    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.615336  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2198  cell division protein MukB  59.59 
 
 
1477 aa  1731    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1085  cell division protein MukB  58.59 
 
 
1486 aa  1738    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0721824  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0727  cell division protein MukB  100 
 
 
1490 aa  3038    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.381088  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1059  cell division protein MukB  58.67 
 
 
1484 aa  1728    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779782  normal  0.0146679 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1000  cell division protein MukB  59 
 
 
1488 aa  1724    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.102163  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1108  cell division protein MukB  59 
 
 
1488 aa  1726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1092  cell division protein MukB  59 
 
 
1488 aa  1726    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.549482 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1027  cell division protein MukB  59.06 
 
 
1488 aa  1725    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.111328 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00928  cell division protein MukB  58.59 
 
 
1486 aa  1738    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.517636  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2196  cell division protein MukB  58.66 
 
 
1486 aa  1740    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.548904  normal  0.255095 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2672  cell division protein MukB  58.59 
 
 
1486 aa  1738    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.610096  normal  0.11245 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2655  cell division protein MukB  59.24 
 
 
1485 aa  1717    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1971  cell division protein MukB  59.24 
 
 
1485 aa  1717    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1725  cell division protein MukB  59.14 
 
 
1482 aa  1714    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.819223  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1023  cell division protein MukB  58.59 
 
 
1486 aa  1737    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000909326  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1031  cell division protein MukB  58.59 
 
 
1486 aa  1737    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.847541  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01589  cell division protein MukB  73.72 
 
 
1489 aa  2221    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2565  cell division protein MukB  59.17 
 
 
1485 aa  1716    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1317  cell division protein MukB  72.42 
 
 
1491 aa  2181    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1443  cell division protein MukB  58.45 
 
 
1482 aa  1723    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.573648  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0866  cell division protein MukB  55.38 
 
 
1468 aa  1612    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2719  chromosome segregation and condensation protein MukB domain protein  58.59 
 
 
1486 aa  1737    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0499442  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2097  cell division protein MukB  24.55 
 
 
1517 aa  142  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.99247  normal  0.0125803 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1493  SMC domain protein  22.5 
 
 
1199 aa  52.8  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.326232  hitchhiker  0.0000000327105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>