29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01588 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01588  condesin subunit E  100 
 
 		 241 aa  488  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003935  chromosome partition protein MukE  98.76 
 
 		 241 aa  483  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0198734  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1318  condesin subunit E  81.9 
 
 		 231 aa  368  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00129388  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0728  condesin subunit E  78.15 
 
 		 238 aa  366  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0231658  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1724  condesin subunit E  66.67 
 
 		 242 aa  319  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.375845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1778  condesin subunit E  69.82 
 
 		 240 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.106258  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1084  condesin subunit E  66.11 
 
 		 243 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000126764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2566  condesin subunit E  72.04 
 
 		 242 aa  312  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2656  condesin subunit E  72.04 
 
 		 242 aa  312  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.3975  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2197  condesin subunit E  66.11 
 
 		 234 aa  312  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00300903  normal  0.107372 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2401  condesin subunit E  66.11 
 
 		 234 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.041151  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2673  condesin subunit E  66.11 
 
 		 234 aa  312  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000253852  normal  0.163487 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1022  condesin subunit E  66.11 
 
 		 234 aa  312  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000226094  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2720  chromosome segregation and condensation protein MukE  66.11 
 
 		 234 aa  312  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000671612  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1030  condesin subunit E  66.11 
 
 		 234 aa  312  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0304428  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1970  condesin subunit E  72.04 
 
 		 251 aa  312  2.9999999999999996e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2300  condesin subunit E  72.04 
 
 		 244 aa  312  3.9999999999999997e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.608848  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1026  condesin subunit E  65.69 
 
 		 243 aa  310  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528099  normal  0.462438 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0999  condesin subunit E  65.69 
 
 		 243 aa  310  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.029339  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2199  condesin subunit E  70.27 
 
 		 238 aa  310  1e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1091  condesin subunit E  65.69 
 
 		 234 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.802381  normal  0.281458 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1107  condesin subunit E  65.69 
 
 		 234 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1058  condesin subunit E  65.69 
 
 		 234 aa  309  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.422947  normal  0.0421691 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2050  condesin subunit E  68.92 
 
 		 240 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.135973  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00927  condesin subunit E  66.96 
 
 		 225 aa  305  6e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0268027  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00934  hypothetical protein  66.96 
 
 		 225 aa  305  6e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0256751  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1442  condesin subunit E  65.98 
 
 		 234 aa  296  3e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.491442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0865  condesin subunit E  65.4 
 
 		 247 aa  288  4e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00171944  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2096  thioredoxin-disulfide reductase  29.55 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.184579  hitchhiker  0.00271395 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>