33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01554 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01554  hypothetical protein  100 
 
 
54 aa  104  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003966  hypothetical protein  85.19 
 
 
54 aa  90.9  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0026413  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1361  hypothetical protein  64.44 
 
 
59 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1455  hypothetical protein  58 
 
 
55 aa  60.5  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1126  hypothetical protein  70.45 
 
 
69 aa  60.1  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2940  hypothetical protein  61.54 
 
 
53 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2719  hypothetical protein  62 
 
 
61 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0797465  hitchhiker  0.000404551 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1131  hypothetical protein  65.91 
 
 
59 aa  57.8  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000143743 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3203  hypothetical protein  65.91 
 
 
51 aa  57.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2884  hypothetical protein  65.91 
 
 
51 aa  57.8  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0375829 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3063  hypothetical protein  65.91 
 
 
51 aa  57.8  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1449  hypothetical protein  59.57 
 
 
70 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000800432  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0946  hypothetical protein  62.22 
 
 
61 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.40771  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1072  hypothetical protein  65.12 
 
 
62 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00677517  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0524  hypothetical protein  60 
 
 
55 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0530  hypothetical protein  60 
 
 
55 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0584  hypothetical protein  60 
 
 
55 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6373  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0540  hypothetical protein  60 
 
 
55 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0521  hypothetical protein  60 
 
 
55 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.992577  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3239  hypothetical protein  59.52 
 
 
59 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225343  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1014  hypothetical protein  55.56 
 
 
54 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.91336  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0556  hypothetical protein  55.56 
 
 
54 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.232895  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0509  hypothetical protein  55.56 
 
 
53 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00283867  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3150  hypothetical protein  58.14 
 
 
53 aa  47  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0343439  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0398  hypothetical protein  58.14 
 
 
53 aa  47  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.244608  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0502  hypothetical protein  58.14 
 
 
53 aa  47  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.140187  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0543  hypothetical protein  58.14 
 
 
53 aa  47  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00417  hypothetical protein  58.14 
 
 
53 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0974376  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00422  hypothetical protein  58.14 
 
 
53 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.118507  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3144  conserved hypothetical protein  58.14 
 
 
53 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0101988  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3044  hypothetical protein  51.06 
 
 
55 aa  44.7  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2181  hypothetical protein  55.81 
 
 
57 aa  43.9  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.560323  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1366  hypothetical protein  53.49 
 
 
67 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000496181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>