33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0540 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0524  hypothetical protein  100 
 
 		 55 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0521  hypothetical protein  100 
 
 		 55 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.992577  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0540  hypothetical protein  100 
 
 		 55 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0584  hypothetical protein  100 
 
 		 55 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0530  hypothetical protein  100 
 
 		 55 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0556  hypothetical protein  80 
 
 		 54 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.232895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0509  hypothetical protein  85.11 
 
 		 53 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00283867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0398  hypothetical protein  82.35 
 
 		 53 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.244608  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0543  hypothetical protein  82.35 
 
 		 53 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0502  hypothetical protein  82.35 
 
 		 53 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.140187  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3150  hypothetical protein  82.35 
 
 		 53 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0343439  normal  0.340963 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3144  conserved hypothetical protein  80.39 
 
 		 53 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0101988  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00422  hypothetical protein  80.39 
 
 		 53 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.118507  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00417  hypothetical protein  80.39 
 
 		 53 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0974376  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0946  hypothetical protein  72.34 
 
 		 61 aa  70.1  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.40771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1072  hypothetical protein  59.62 
 
 		 62 aa  60.5  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00677517  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3239  hypothetical protein  55.56 
 
 		 59 aa  58.5  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225343  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1014  hypothetical protein  55.77 
 
 		 54 aa  54.3  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.91336  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2884  hypothetical protein  54.9 
 
 		 51 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0375829 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3063  hypothetical protein  54.9 
 
 		 51 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3203  hypothetical protein  54.9 
 
 		 51 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01554  hypothetical protein  60 
 
 		 54 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1131  hypothetical protein  60.87 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000143743 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3044  hypothetical protein  63.64 
 
 		 55 aa  51.2  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003966  hypothetical protein  57.78 
 
 		 54 aa  50.4  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0026413  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1449  hypothetical protein  55.56 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000800432  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1126  hypothetical protein  54.76 
 
 		 69 aa  47  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2940  hypothetical protein  58.14 
 
 		 53 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1366  hypothetical protein  51.11 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000496181 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1455  hypothetical protein  52.27 
 
 		 55 aa  44.3  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2181  hypothetical protein  57.14 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.560323  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2719  hypothetical protein  52.27 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0797465  hitchhiker  0.000404551 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1361  hypothetical protein  50 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>