28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001375 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001375  putative transcriptional regulator MerR family protein  100 
 
 		 61 aa  118  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108021  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4050  MerR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3872  transcriptional regulator, MerR family protein  53.33 
 
 		 118 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0088  MerR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0082  MerR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0085  transcriptional regulator, MerR family  50.88 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4267  MerR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0088  MerR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0082  MerR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1569  MerR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.418349 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4935  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327998  normal  0.0174485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7602  putative transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621201  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0636  transcriptional regulator, MerR family  38.6 
 
 		 160 aa  45.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7947  putative transcriptional regulator, MerR family  35.09 
 
 		 124 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1516  MerR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 201 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.699928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1782  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1868  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158881  hitchhiker  0.000791021 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1754  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3285  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200558  normal  0.212235 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2220  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  33.93 
 
 		 491 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1844  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.051898  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6235  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204034  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3507  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2258  MerR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0033  MerR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154988  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1374  MerR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3138  MerR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.267666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>