29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2482 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2482  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  187  4e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002048  protein YihD  85.23 
 
 		 88 aa  145  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00401  hypothetical protein  82.61 
 
 		 92 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4106  hypothetical protein  72.73 
 
 		 89 aa  140  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0347874  normal  0.2689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4520  protein of unknown function DUF1040  71.59 
 
 		 89 aa  139  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3970  protein of unknown function DUF1040  70.45 
 
 		 89 aa  138  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000166311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4239  hypothetical protein  70.45 
 
 		 89 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00126371  normal  0.14287 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03693  hypothetical protein  70.45 
 
 		 89 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.73477  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5298  hypothetical protein  70.45 
 
 		 89 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.122194  normal  0.744851 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03744  hypothetical protein  70.45 
 
 		 89 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.914175  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4157  hypothetical protein  70.45 
 
 		 89 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00484302  hitchhiker  0.0000595755 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4128  protein of unknown function DUF1040  70.45 
 
 		 89 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4376  hypothetical protein  70.45 
 
 		 89 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000544122  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4081  hypothetical protein  70.45 
 
 		 89 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000071342  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4383  hypothetical protein  69.32 
 
 		 89 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4230  hypothetical protein  70.45 
 
 		 89 aa  137  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4226  hypothetical protein  69.32 
 
 		 89 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00453058  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4205  hypothetical protein  69.32 
 
 		 89 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0624678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4322  hypothetical protein  69.32 
 
 		 89 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.948966 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4276  hypothetical protein  69.32 
 
 		 89 aa  137  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.200378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4330  hypothetical protein  69.32 
 
 		 89 aa  136  7.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0020  hypothetical protein  71.59 
 
 		 89 aa  136  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0229124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0018  hypothetical protein  71.59 
 
 		 89 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000602273  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4198  hypothetical protein  71.59 
 
 		 89 aa  136  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.829347  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4167  protein of unknown function DUF1040  69.32 
 
 		 89 aa  134  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0267466  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4891  hypothetical protein  71.59 
 
 		 89 aa  134  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000756165  hitchhiker  0.000000586556 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0047  hypothetical protein  67.82 
 
 		 87 aa  132  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.15035  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0309  hypothetical protein  58.62 
 
 		 88 aa  114  6e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0070  hypothetical protein  48.28 
 
 		 87 aa  93.2  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>